RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 ITIH2P19823 946 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 RING1Q06587 406 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 AOC3Q16853 763 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 PCNX4Q63HM2 1172 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 ANKRD24Q8TF21 1146 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM8A1Q9UBU6 413 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 CYP8B1Q9UNU6 501 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 TONSLQ96HA7 1378 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARHGEF11O15085 1522 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 MYOM3Q5VTT5 1437 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM265A0A087WTH1 108 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 FANCGO15287 622 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 LDHBP07195 334 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 FUT4P22083 530 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 JAG1P78504 1218 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 FZD5Q13467 585 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 INPP5AQ14642 412 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZBTB37Q5TC79 503 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 CDC37L1Q7L3B6 337 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM214BQ7L5A3 538 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 ELMO3Q96BJ8 720 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 HRASLS5Q96KN8 279 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRDM10Q9NQV6 1147 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 TOPBP1Q92547 1522 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 GRIN2BQ13224 1484 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 NCOA2Q15596 1464 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 FANCD2Q9BXW9 1451 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 PAPLNO95428 1278 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 SCARA3Q6AZY7 606 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRAIPQ9BWF2 469 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 UGGT2Q9NYU1 1516 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 FANCIQ9NVI1 1328 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 BIN1O00499 593 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 LRFN4Q6PJG9 635 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 SV2BQ7L1I2 683 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 KCT2Q8NC54 265 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 PI4K2BQ8TCG2 481 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF507Q8TCN5 953 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 TNKS2Q9H2K2 1166 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 KDM5BQ9UGL1 1544 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 NAIPQ13075 1403 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 FHOD3Q2V2M9 1422 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 MIA2Q96PC5 1412 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 MTUS2Q5JR59 1369 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 EOMESO95936 686 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 GNA15P30679 374 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 CDK8P49336 464 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARMCX6Q7L4S7 300 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 GAL3ST3Q96A11 431 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 PLPPR2Q96GM1 343 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 FRMD6Q96NE9 622 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 FBRSQ9HAH7 460 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 RNF19AQ9NV58 838 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 SNX11Q9Y5W9 270 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 GNAT3A8MTJ3 354 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 LRIG2O94898 1065 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 C8AP07357 584 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 ITGAEP38570 1179 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 NKPD1Q17RQ9 610 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 TTBK2Q6IQ55 1244 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 CYFIP1Q7L576 1253 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 HDXQ7Z353 690 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 SPACA3Q8IXA5 215 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 LRRN4CLQ8ND94 238 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 ASB11Q8WXH4 323 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRDM7Q9NQW5 492 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 AK5Q9Y6K8 562 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 CNTLNQ9NXG0 1405 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLITRK5O94991 958 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 ETF1P62495 437 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-55P-201ENST00000411092 NKG7Q16617 165 aa4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms