RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379599.6

NHLRC3-201, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLRC3, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM107AO95990 144 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 MYBPC3Q14896 1274 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 GALNT17Q6IS24 598 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 TAX1BP1Q86VP1 789 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 PHC3Q8NDX5 983 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 CYFIP2Q96F07 1278 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 RCOR1Q9UKL0 485 aa9.53□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 SYNJ2O15056 1496 aa9.52□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 C9orf84Q5VXU9 1444 aa9.52□□□□□ -0.88
NHLRC3-201ENST00000379599 A6NHS1 94 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 STXBP3O00186 592 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 ENC1O14682 589 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 N4BP3O15049 544 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 NAT1P18440 290 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 GJA8P48165 433 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 NDUFA8P51970 172 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.894e-8■■■■□ 21
NHLRC3-201ENST00000379599 XRCC4Q13426 336 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 LONRF3Q496Y0 759 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 SFMBT2Q5VUG0 894 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 C8orf76Q96K31 380 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 BACH1O14867 736 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 EVI5O60447 810 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF24P17028 368 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 HPDP32754 393 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 CA8P35219 290 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 TAF11Q15544 211 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 CCDC70Q6NSX1 233 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 RAD9BQ6WBX8 426 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 CCDC63Q8NA47 563 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 MMS19Q96T76 1030 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 MBIPQ9NS73 344 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 GALNT8Q9NY28 637 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 FANCAO15360 1455 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 ADGRL2O95490 1459 aa9.52□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 SRGAP2O75044 1071 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 DESP17661 470 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 PTH1RQ03431 593 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 C6orf89Q6UWU4 347 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 AGAP11Q8TF27 550 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 PAGR1Q9BTK6 254 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 TRIM7Q9C029 511 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 PCMTD2Q9NV79 361 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 RHBDL2Q9NX52 303 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM184BQ9ULE4 1060 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 IKBKBO14920 756 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 CYP27B1O15528 508 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 KRT14P02533 472 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 OLFM4Q6UX06 510 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 ARHGEF25Q86VW2 580 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 ZFAND2BQ8WV99 257 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 MKL1Q969V6 931 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 DTNBP1Q96EV8 351 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 ABL1P00519 1130 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 PDHA1P08559 390 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 NR1D1P20393 614 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 ABL2P42684 1182 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 GUCY1B3Q02153 619 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 TMEM110Q86TL2 294 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 PPFIBP1Q86W92 1011 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 MAIP1Q8WWC4 291 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 SLX1AQ9BQ83 275 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 PREBQ9HCU5 417 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC5A4Q9NY91 659 aa9.51□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 CNGA1P29973 690 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 ALDH3A1P30838 453 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 MAP3K12Q12852 859 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 CCHCR1Q8TD31 782 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 UNC45AQ9H3U1 944 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 SUN2Q9UH99 717 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 ADCY10Q96PN6 1610 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 PFDN1O60925 122 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 PCK1P35558 622 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 HOOK3Q86VS8 718 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 PANK4Q9NVE7 773 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 SPATA7Q9P0W8 599 aa9.5□□□□□ -0.89
NHLRC3-201ENST00000379599 GGA2Q9UJY4 613 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms