RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 DGKZQ13574 1117 aa32.43■■■□□ 2.78
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TPGS1-201ENST00000359315 GPAT2Q6NUI2 795 aa32.43■■■□□ 2.78
TPGS1-201ENST00000359315 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
TPGS1-201ENST00000359315 SPP2Q13103 211 aa32.42■■■□□ 2.78
TPGS1-201ENST00000359315 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
TPGS1-201ENST00000359315 USP17L5A8MUK1 530 aa32.41■■■□□ 2.78
TPGS1-201ENST00000359315 GH2P01242 217 aa32.41■■■□□ 2.78
TPGS1-201ENST00000359315 ASNSP08243 561 aa32.41■■■□□ 2.78
TPGS1-201ENST00000359315 C12orf60Q5U649 245 aa32.41■■■□□ 2.78
TPGS1-201ENST00000359315 CTR9Q6PD62 1173 aa32.41■■■□□ 2.78
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa32.41■■■□□ 2.78
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD23Q86SG2 305 aa32.41■■■□□ 2.78
TPGS1-201ENST00000359315 PHIPQ8WWQ0 1821 aa32.41■■■□□ 2.78
TPGS1-201ENST00000359315 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
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TPGS1-201ENST00000359315 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa32.39■■■□□ 2.78
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa32.39■■■□□ 2.78
TPGS1-201ENST00000359315 PDHXO00330 501 aa32.39■■■□□ 2.78
TPGS1-201ENST00000359315 GADL1Q6ZQY3 521 aa32.39■■■□□ 2.78
TPGS1-201ENST00000359315 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 RILPL2Q969X0 211 aa32.38■■■□□ 2.77
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TPGS1-201ENST00000359315 FOXP2O15409 715 aa32.37■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 FAM227BQ96M60 508 aa32.37■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa32.37■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 A0A0D9SFI3 127 aa32.36■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 FKTNO75072 461 aa32.36■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 GUCY1A2P33402 732 aa32.36■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 HMGCS2P54868 508 aa32.36■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 CAP1Q01518 475 aa32.36■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 TREML2Q5T2D2 321 aa32.36■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 DDRGK1Q96HY6 314 aa32.36■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 WDR18Q9BV38 432 aa32.36■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 MTMR2Q13614 643 aa32.35■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 ABCB5Q2M3G0 1257 aa32.35■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 AS3MTQ9HBK9 375 aa32.35■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 CYP2C8P10632 490 aa32.34■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 TBC1D2Q9BYX2 928 aa32.34■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 MCOLN1Q9GZU1 580 aa32.34■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 GINM1Q9NU53 330 aa32.34■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 ADGRA2Q96PE1 1338 aa32.33■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 GNAT2P19087 354 aa32.33■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 RAB3GAP1Q15042 981 aa32.33■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 GIMAP6Q6P9H5 292 aa32.33■■■□□ 2.77
TPGS1-201ENST00000359315 C16orf86Q6ZW13 317 aa32.33■■■□□ 2.77
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TPGS1-201ENST00000359315 APPP05067 770 aa32.32■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
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TPGS1-201ENST00000359315 SH3D19Q5HYK7 790 aa32.32■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 VPS53Q5VIR6 699 aa32.32■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 IFNL3Q8IZI9 196 aa32.32■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 STK11IPQ8N1F8 1099 aa32.32■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 SWAP70Q9UH65 585 aa32.32■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa32.32■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 AKR1B1P15121 316 aa32.31■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 TDO2P48775 406 aa32.31■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 BACE1P56817 501 aa32.31■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 SEPT2Q15019 361 aa32.31■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 AMOTL1Q8IY63 956 aa32.31■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 CD99L2Q8TCZ2 262 aa32.31■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 CPA4Q9UI42 421 aa32.31■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 PTPRFP10586 1907 aa32.3■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 MINDY4BA8MYZ0 360 aa32.3■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 CLEC10AQ8IUN9 316 aa32.3■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 ACER1Q8TDN7 264 aa32.3■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 HELLSQ9NRZ9 838 aa32.3■■■□□ 2.76
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TPGS1-201ENST00000359315 SDSP20132 328 aa32.29■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 SP3Q02447 781 aa32.29■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 TTC22Q5TAA0 569 aa32.29■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 CABP5Q9NP86 173 aa32.29■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 SKAP1Q86WV1 359 aa32.28■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 ROBO3Q96MS0 1386 aa32.28■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 USP17L10C9JJH3 530 aa32.27■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 C17orf99Q6UX52 265 aa32.27■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 EMILIN3Q9NT22 766 aa32.27■■■□□ 2.76
TPGS1-201ENST00000359315 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa32.26■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa32.26■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 LOC285556D6RIA3 1793 aa32.26■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 NAPBQ9H115 298 aa32.25■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 TAOK2Q9UL54 1235 aa32.25■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 A0A1W2PRG0 241 aa32.24■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM179Q6ZVK1 233 aa32.24■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 ERO1AQ96HE7 468 aa32.24■■■□□ 2.75
TPGS1-201ENST00000359315 ABHD8Q96I13 439 aa32.24■■■□□ 2.75
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