RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 CSRNP2Q9H175 543 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 CABP7Q86V35 215 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 VPS54Q9P1Q0 977 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 TFAP4Q01664 338 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 PPP2R5CQ13362 524 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 GTF3C6Q969F1 213 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 KRT25Q7Z3Z0 450 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 GCKRQ14397 625 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 EXOC3O60645 756 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 UBL4BQ8N7F7 174 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 USP40Q9NVE5 1235 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 USP21Q9UK80 565 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM14Q14142 442 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 PSMB7Q99436 277 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 PPIP5K2O43314 1243 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 CLCN1P35523 988 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 C8orf74Q6P047 294 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF365Q70YC5 407 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 HDXQ7Z353 690 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.583e-9■■■□□ 19.2
PTPRM-201ENST00000332175 LRMPQ12912 555 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 TPH2Q8IWU9 490 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 CLSTN2Q9H4D0 955 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 GTF2IP78347 998 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 NELFBQ8WX92 580 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 MYO1AQ9UBC5 1043 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 DLGAP5Q15398 846 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 RDH13Q8NBN7 331 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 EBAG9O00559 213 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.583e-18■■■■■ 81.5
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF202O95125 648 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 ZWINTO95229 277 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 KRT40Q6A162 431 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 HSPA1LP34931 641 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 CDC37L1Q7L3B6 337 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 RBSNQ9H1K0 784 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 JAK2O60674 1132 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 DAAM2Q86T65 1068 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 TTLL3Q9Y4R7 772 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 CLUL1Q15846 466 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 CD19P15391 556 aa24.89■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 GLT8D2Q9H1C3 349 aa24.89■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 DCUN1D2Q6PH85 259 aa24.89■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 ITIH3Q06033 890 aa24.89■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 NOX5Q96PH1 765 aa24.89■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.89■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 DNM2P50570 870 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 STK10O94804 968 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 GMNNO75496 209 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 NLRP12P59046 1061 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP44Q17R89 818 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 SGSM2O43147 1006 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 POSTNQ15063 836 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 KLHL7Q8IXQ5 586 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 IGSF3O75054 1194 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 M0QZ92 97 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 HGSO14964 777 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 PPARAQ07869 468 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 CBX8Q9HC52 389 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 CFAP57Q96MR6 1250 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 ANO3Q9BYT9 981 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 E7EWF7 191 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 TBX22Q9Y458 520 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.575e-6■□□□□ 9.7
PTPRM-201ENST00000332175 TUBB4BP68371 445 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 METTL13Q8N6R0 699 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 CEP104O60308 925 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 ATP5DP30049 168 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 STK24Q9Y6E0 443 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRM-201ENST00000332175 ASIC3Q9UHC3 531 aa24.86■■□□□ 1.57
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