RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 NEMFO60524 1076 aa23.07■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 CCDC93Q567U6 631 aa23.07■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.07■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.07■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 ERFEQ4G0M1 354 aa23.06■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.06■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.06■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.06■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 LIFRP42702 1097 aa23.06■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 PTPAQ15257 358 aa23.06■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.06■■□□□ 1.28
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HPS6-201ENST00000299238 BANK1Q8NDB2 785 aa23.05■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 GOLGA5Q8TBA6 731 aa23.05■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.05■■□□□ 1.28
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HPS6-201ENST00000299238 MAP3K14Q99558 947 aa23.05■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.05■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.05■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.04■■□□□ 1.28
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HPS6-201ENST00000299238 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.04■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 PPP6R2O75170 966 aa23.04■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 SMC2O95347 1197 aa23.04■■□□□ 1.28
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HPS6-201ENST00000299238 NLRP12P59046 1061 aa23.04■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.04■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.04■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 HPSEQ9Y251 543 aa23.04■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.03■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.03■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa23.03■■□□□ 1.28
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HPS6-201ENST00000299238 SHC4Q6S5L8 630 aa23.03■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 CLIC6Q96NY7 704 aa23.03■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 KRT23Q9C075 422 aa23.03■■□□□ 1.28
HPS6-201ENST00000299238 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
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HPS6-201ENST00000299238 NID2Q14112 1375 aa23.02■■□□□ 1.28
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HPS6-201ENST00000299238 STK36Q9NRP7 1315 aa23.02■■□□□ 1.28
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HPS6-201ENST00000299238 ATP2B1P20020 1258 aa23.01■■□□□ 1.27
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HPS6-201ENST00000299238 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.01■■□□□ 1.27
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HPS6-201ENST00000299238 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.01■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.01■■□□□ 1.27
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HPS6-201ENST00000299238 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
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HPS6-201ENST00000299238 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa23■■□□□ 1.27
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HPS6-201ENST00000299238 CYP7A1P22680 504 aa23■■□□□ 1.27
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HPS6-201ENST00000299238 ATP1A3P13637 1013 aa22.99■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 IFNAR1P17181 557 aa22.99■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 SPECC1Q5M775 1068 aa22.99■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 RESP18Q5W5W9 173 aa22.99■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 CEP83Q9Y592 693 aa22.99■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 ACTN2P35609 894 aa22.98■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 PNOCQ13519 176 aa22.98■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 TRIM29Q14134 588 aa22.98■■□□□ 1.27
HPS6-201ENST00000299238 UBE4AQ14139 1066 aa22.98■■□□□ 1.27
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