RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000099241.3

Ccl28-201, Transcript of C-C motif chemokine 28, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccl28, Length 3,740 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28-201ENSMUST00000099241 PparaP23204 468 aa6.65□□□□□ -1.34
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Gucy2cQ3UWA6 1072 aa6.65□□□□□ -1.34
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Zranb3Q6NZP1 1069 aa6.65□□□□□ -1.34
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Slc35g1Q8BY79 368 aa6.65□□□□□ -1.34
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Alx1Q8C8B0 326 aa6.65□□□□□ -1.34
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ttc19Q8CC21 365 aa6.65□□□□□ -1.34
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Pdia6Q922R8 440 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Smco2Q9DA21 347 aa6.65□□□□□ -1.34
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Simc1E9Q6E9 1354 aa6.65□□□□□ -1.34
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Med23Q80YQ2 1367 aa6.65□□□□□ -1.34
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Mon2Q80TL7 1715 aa6.65□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Cdc27A2A6Q5 825 aa6.65□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Zbtb21E9Q444 1094 aa6.65□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Gm10378F6XQQ1 160 aa6.65□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Slc30a9Q5IRJ6 567 aa6.65□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ppp2r5bQ6PD28 497 aa6.65□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Nop9Q8BMC4 636 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Slc39a6Q8C145 765 aa6.65□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Zkscan3Q91VW9 553 aa6.65□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ebag9Q9D0V7 213 aa6.65□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Mrps25Q9D125 171 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Calml3Q9D6P8 149 aa6.65□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Klc4Q9DBS5 619 aa6.65□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Pdcd6ipQ9WU78 869 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Mast3Q3U214 1321 aa6.65□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Rexo5D3YW29 759 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 NpcdF8VQB8 469 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ugt1a6bK9J7B2 531 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Tcp11Q01755 566 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Sun3Q5SS91 320 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Mybpc2Q5XKE0 1136 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Prdm1Q60636 856 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Cyp7b1Q60991 507 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Cnga2Q62398 664 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ugt1a6Q64435 531 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ugt1a7cQ6ZQM8 531 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Gpt2Q8BGT5 522 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Cfap69Q8BH53 942 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Rnf41Q8BH75 317 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Lrrd1Q8C0R9 853 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Eif3cQ8R1B4 911 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 WtapQ9ER69 396 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Itga2bQ9QUM0 1033 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Syde2E9PUP1 1314 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 C3P01027 1663 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Lipo1J3QME6 396 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Api5O35841 504 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Pak1O88643 545 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Pde6aP27664 859 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Opa1P58281 960 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Stim2P83093 746 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Atp8a2P98200 1148 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 ZyxQ62523 564 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Hexim1Q8R409 356 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Farp2Q91VS8 1065 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ehd4Q9EQP2 541 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Copb1Q9JIF7 953 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Eif2ak3Q9Z2B5 1114 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Setdb1O88974 1307 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Kif23E9Q5G3 953 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Snx12O70493 165 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ckap2Q3V1H1 664 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Klra4Q60651 263 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Gngt1Q61012 74 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Igbp1Q61249 340 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Slc44a1Q6X893 653 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Csrnp2Q8BGQ2 534 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Micall1Q8BGT6 870 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Spata4Q8K3V1 295 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Pcdha12Q91Y18 950 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Syf2Q9D198 242 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 CenphQ9QYM8 241 aa6.64□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Gm28919A0A087WP35 240 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Pcdhb9E9Q5G2 828 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Psmd14O35593 310 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Nid2O88322 1403 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Krt86P97861 486 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 IntuQ059U7 942 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ice2Q3UZ18 988 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 AcrbpQ3V140 540 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 EsrrbQ61539 433 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Lrrn2Q6PHP6 730 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Pabpc4Q6PHQ9 660 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Jade2Q6ZQF7 829 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Hirip3Q8BLH7 601 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Larp6Q8BN59 492 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ccdc38Q8CDN8 563 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Trim52Q8CDV4 233 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ces1hD3Z298 562 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Casp12O08736 419 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Zmym1Q3TJB1 983 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Olfr121Q5CZY0 321 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Clic6Q8BHB9 596 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Fermt2Q8CIB5 680 aa6.63□□□□□ -1.35
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Kcnj14Q8JZN3 434 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.3 ms