RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001872.4

Hoxd13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd13, Length 2,483 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Setdb1O88974 1307 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Med23Q80YQ2 1367 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ppfia4B8QI36 1187 aa22.33■■□□□ 1.17
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dnajc21E9Q8D0 531 aa22.33■■□□□ 1.17
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fam213aQ9CYH2 218 aa22.33■■□□□ 1.17
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Egfl6Q9JJZ5 550 aa22.33■■□□□ 1.17
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Scgb2b18A0A087WPA9 112 aa22.33■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trim55G3X8Y1 545 aa22.33■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Plekhf1Q3TB82 279 aa22.33■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cfap45Q9D9U9 551 aa22.33■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Suclg2Q9Z2I8 433 aa22.33■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 CrklP47941 303 aa22.32■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tubb5P99024 444 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Top1Q04750 767 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Adck2Q6NSR3 617 aa22.32■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Apol10aQ8CCA5 318 aa22.32■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Eaf2Q91ZD6 262 aa22.32■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa22.32■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Olfr121Q5CZY0 321 aa22.32■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tmem232Q5K6N0 675 aa22.32■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cep128Q8BI22 1102 aa22.32■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Slain2Q8CI08 581 aa22.32■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Q8K2W9 541 aa22.32■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zkscan3Q91VW9 553 aa22.32■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Txndc5Q91W90 417 aa22.32■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nfu1Q9QZ23 255 aa22.32■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Chp1P61022 195 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tcp11Q01755 566 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 C87499Q3UX49 493 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vipas39Q8BGQ1 491 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cgref1Q8R1U2 281 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vmn1r218Q8R261 298 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Hsd3b7Q9EQC1 369 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cnbd1B1AWM0 430 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ckap2Q3V1H1 664 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fam160b2Q80YR2 744 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zkscan8Q8BSL0 588 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gpr108Q91WD0 569 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm5580A0A0N4SVP8 411 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 4932429P05RikA2ADI4 785 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm1979E9QAN3 267 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Casp12O08736 419 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Akap2O54931 893 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sdad1Q80UZ2 687 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vps53Q8CCB4 832 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Wasf1Q8R5H6 559 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Srgap2Q91Z67 1071 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krt84Q99M73 603 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Uso1Q9Z1Z0 959 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ftl2P49945 183 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Caps2Q8BUG5 550 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Amigo3Q8C2S7 508 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Smc2Q8CG48 1191 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 GzmnQ920S1 248 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 AvenQ9D9K3 342 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Knop1Q9Z2Q2 478 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Myh7Q91Z83 1935 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ttc12Q8BW49 704 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rtn1Q8K0T0 780 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 GdaQ9R111 454 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Folh1O35409 752 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tpp1O89023 562 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sun3Q5SS91 320 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kif2bQ8C0N1 668 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lrrd1Q8C0R9 853 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zfp446Q8C9M8 523 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tmem39aQ9CYC3 486 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tfcp2Q9ERA0 502 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Myh1Q5SX40 1942 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Phldb3E9QAF4 648 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Enc1O35709 589 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Def6Q8C2K1 630 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 SyncQ9EPM5 470 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Uchl5Q9WUP7 329 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 C2cd2E9Q3C1 696 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Wee1P47810 646 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 BcanQ61361 883 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mrc1Q61830 1456 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lrrc4bP0C192 709 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PparaP23204 468 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kiaa1468Q148V7 1216 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fam89aQ14BJ1 175 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc174Q3U155 467 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nlrp9aQ66X03 949 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 VmacQ8BP01 174 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Osbpl1aQ91XL9 950 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mkrn1Q9QXP6 481 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Stk39Q9Z1W9 556 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 CluhQ5SW19 1315 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ugt1a8D3Z748 530 aa22.26■■□□□ 1.15
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ugt1a10E9PXN7 530 aa22.26■■□□□ 1.15
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pla2g4aP47713 748 aa22.26■■□□□ 1.15
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Smarca1Q6PGB8 1046 aa22.26■■□□□ 1.15
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cep85Q8BMK0 761 aa22.26■■□□□ 1.15
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Bpifb6Q8BU51 449 aa22.26■■□□□ 1.15
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lmod1Q8BVA4 595 aa22.26■■□□□ 1.15
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tmx4Q8C0L0 335 aa22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.6 ms