RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000022469.12

Nisch-201, Transcript of Nischarin, mousemouse

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene Nisch, Length 5,559 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm37013Q8K491 104 aa13□□□□□ -0.33
Nisch-201ENSMUST00000022469 Usp24B1AY13 2617 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
Nisch-201ENSMUST00000022469 Mki67E9PVX6 3177 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
Nisch-201ENSMUST00000022469 FasnP19096 2504 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm7137J3QMW1 236 aa12.95□□□□□ -0.34
Nisch-201ENSMUST00000022469 Map1aQ9QYR6 2776 aa12.94□□□□□ -0.34
Nisch-201ENSMUST00000022469 Chd7A2AJK6 2986 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm20538F6Z9R1 75 aa12.93□□□□□ -0.34
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm16253D3Z167 63 aa12.92□□□□□ -0.34
Nisch-201ENSMUST00000022469 SmcpP15265 143 aa12.92□□□□□ -0.34
Nisch-201ENSMUST00000022469 Jbts17Q8CE72 3214 aa12.92□□□□□ -0.34
Nisch-201ENSMUST00000022469 AtrQ9JKK8 2635 aa12.91□□□□□ -0.34
Nisch-201ENSMUST00000022469 Col12a1Q60847 3120 aa12.9□□□□□ -0.34
Nisch-201ENSMUST00000022469 Notch1Q01705 2531 aa12.88□□□□□ -0.35
Nisch-201ENSMUST00000022469 Fn1P11276 2477 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
Nisch-201ENSMUST00000022469 FlnbQ80X90 2602 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
Nisch-201ENSMUST00000022469 4933415A04RikQ9D443 101 aa12.81□□□□□ -0.36
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm7173A0A0G2JEB6 3132 aa12.8□□□□□ -0.36
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm9821Q8K076 103 aa12.8□□□□□ -0.36
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm9508A0A1W2P7W0 230 aa12.79□□□□□ -0.36
Nisch-201ENSMUST00000022469 Bod1lE9Q6J5 3032 aa12.74□□□□□ -0.37
Nisch-201ENSMUST00000022469 NipblQ6KCD5 2798 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
Nisch-201ENSMUST00000022469 Kmt2bO08550 2713 aa12.72□□□□□ -0.37
Nisch-201ENSMUST00000022469 Rev3lQ61493 3122 aa12.72□□□□□ -0.37
Nisch-201ENSMUST00000022469 Hectd1Q69ZR2 2618 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
Nisch-201ENSMUST00000022469 1700042G07RikB1AUF7 90 aa12.71□□□□□ -0.37
Nisch-201ENSMUST00000022469 Pla2g10Q9QXX3 151 aa12.71□□□□□ -0.37
Nisch-201ENSMUST00000022469 Cdh23Q99PF4 3354 aa12.64□□□□□ -0.39
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap29-1A2A5X4 342 aa12.63□□□□□ -0.39
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm17349F7BGH6 99 aa12.62□□□□□ -0.39
Nisch-201ENSMUST00000022469 Stab1Q8R4Y4 2571 aa12.61□□□□□ -0.39
Nisch-201ENSMUST00000022469 Spink7Q6IE32 76 aa12.59□□□□□ -0.39
Nisch-201ENSMUST00000022469 Myo15bI7HPW8 3033 aa12.58□□□□□ -0.4
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm36176A0A1W2P8D5 158 aa12.57□□□□□ -0.4
Nisch-201ENSMUST00000022469 Cfap54Q8C6S9 3106 aa12.56□□□□□ -0.4
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm2310J3QNJ2 377 aa12.54□□□□□ -0.4
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap15-1Q9QZU5 150 aa12.54□□□□□ -0.4
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ash1lQ99MY8 2958 aa12.49□□□□□ -0.41
Nisch-201ENSMUST00000022469 Itpr1P11881 2749 aa12.49□□□□□ -0.41
Nisch-201ENSMUST00000022469 Rpl37Q9D823 97 aa12.48□□□□□ -0.41
Nisch-201ENSMUST00000022469 Dmxl1Q6PNC0 3013 aa12.48□□□□□ -0.41
Nisch-201ENSMUST00000022469 Romo1P60603 79 aa12.47□□□□□ -0.41
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ranbp2Q9ERU9 3053 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
Nisch-201ENSMUST00000022469 Akap13E9Q394 2776 aa12.43□□□□□ -0.42
Nisch-201ENSMUST00000022469 Fbn2Q61555 2907 aa12.42□□□□□ -0.42
Nisch-201ENSMUST00000022469 Szt2A2A9C3 3431 aa12.41□□□□□ -0.42
Nisch-201ENSMUST00000022469 Chd6A3KFM7 2711 aa12.41□□□□□ -0.42
Nisch-201ENSMUST00000022469 2310050C09RikG5E8Z3 280 aa12.38□□□□□ -0.43
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm5767A0A0J9YTU8 78 aa12.33□□□□□ -0.44
Nisch-201ENSMUST00000022469 Itpr3P70227 2670 aa12.32□□□□□ -0.44
Nisch-201ENSMUST00000022469 KalrnA2CG49 2964 aa12.32□□□□□ -0.44
Nisch-201ENSMUST00000022469 MgaA2AWL7 3003 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
Nisch-201ENSMUST00000022469 Camk2n1Q6QWF9 78 aa12.29□□□□□ -0.44
Nisch-201ENSMUST00000022469 Vps13aQ5H8C4 3166 aa12.28□□□□□ -0.44
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm10382Q3V0T5 144 aa12.28□□□□□ -0.44
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap13O88375 197 aa12.26□□□□□ -0.45
Nisch-201ENSMUST00000022469 Mast4Q811L6 2618 aa12.24□□□□□ -0.45
Nisch-201ENSMUST00000022469 Tep1P97499 2629 aa12.23□□□□□ -0.45
Nisch-201ENSMUST00000022469 2310061N02RikQ9D6S9 174 aa12.22□□□□□ -0.45
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap14O08640 167 aa12.2□□□□□ -0.46
Nisch-201ENSMUST00000022469 Fam229aB2KGE5 128 aa12.18□□□□□ -0.46
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ubr5Q80TP3 2792 aa12.18□□□□□ -0.46
Nisch-201ENSMUST00000022469 Unc80Q8BLN6 3261 aa12.17□□□□□ -0.46
Nisch-201ENSMUST00000022469 AtmQ62388 3066 aa12.16□□□□□ -0.46
Nisch-201ENSMUST00000022469 BC029722A0A0N4SW31 51 aa12.14□□□□□ -0.47
Nisch-201ENSMUST00000022469 Stab2Q8R4U0 2559 aa12.1□□□□□ -0.47
Nisch-201ENSMUST00000022469 Sec61bQ9CQS8 96 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm9507D3Z5T3 223 aa12.08□□□□□ -0.48
Nisch-201ENSMUST00000022469 Lrrc37aB1AWG4 3215 aa12.07□□□□□ -0.48
Nisch-201ENSMUST00000022469 Tnp2P11378 117 aa12.06□□□□□ -0.48
Nisch-201ENSMUST00000022469 Rps29P62274 56 aa12.06□□□□□ -0.48
Nisch-201ENSMUST00000022469 Cox6b2Q80ZN9 88 aa12.06□□□□□ -0.48
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm19426M0QWC7 77 aa12.02□□□□□ -0.48
Nisch-201ENSMUST00000022469 Igsf10Q3V1M1 2594 aa12.02□□□□□ -0.49
Nisch-201ENSMUST00000022469 AspmQ8CJ27 3122 aa11.97□□□□□ -0.49
Nisch-201ENSMUST00000022469 Muc2Q80Z19 2680 aa11.94□□□□□ -0.5
Nisch-201ENSMUST00000022469 D6Ertd527eA0A0N4SWI3 464 aa11.94□□□□□ -0.5
Nisch-201ENSMUST00000022469 9530053A07RikE9PVG8 2581 aa11.94□□□□□ -0.5
Nisch-201ENSMUST00000022469 FrylF8VQ05 3007 aa11.93□□□□□ -0.5
Nisch-201ENSMUST00000022469 Nbeal2Q6ZQA0 2742 aa11.92□□□□□ -0.5
Nisch-201ENSMUST00000022469 Lama1P19137 3084 aa11.9□□□□□ -0.51
Nisch-201ENSMUST00000022469 Celsr1O35161 3034 aa11.89□□□□□ -0.51
Nisch-201ENSMUST00000022469 Frem2Q6NVD0 3160 aa11.88□□□□□ -0.51
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap10-4Q08EG8 221 aa11.88□□□□□ -0.51
Nisch-201ENSMUST00000022469 Wdfy4E9Q2M9 3149 aa11.88□□□□□ -0.51
Nisch-201ENSMUST00000022469 Celsr3Q91ZI0 3301 aa11.87□□□□□ -0.51
Nisch-201ENSMUST00000022469 Pkd1l1Q8R526 2615 aa11.83□□□□□ -0.52
Nisch-201ENSMUST00000022469 Col6a5A6H584 2640 aa11.78□□□□□ -0.52
Nisch-201ENSMUST00000022469 TgO08710 2766 aa11.77□□□□□ -0.53
Nisch-201ENSMUST00000022469 Utp20Q5XG71 2788 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
Nisch-201ENSMUST00000022469 Tex15F8VPN2 2785 aa11.72□□□□□ -0.53
Nisch-201ENSMUST00000022469 BptfA2A654 3036 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap10-10A0A1W2P7T6 217 aa11.7□□□□□ -0.54
Nisch-201ENSMUST00000022469 Itpr2Q9Z329 2701 aa11.69□□□□□ -0.54
Nisch-201ENSMUST00000022469 Brca2P97929 3329 aa11.69□□□□□ -0.54
Nisch-201ENSMUST00000022469 Hivep1Q03172 2688 aa11.69□□□□□ -0.54
Nisch-201ENSMUST00000022469 FryE9Q8I9 3020 aa11.66□□□□□ -0.54
Nisch-201ENSMUST00000022469 Adgrg4B7ZCC9 3073 aa11.65□□□□□ -0.55
Nisch-201ENSMUST00000022469 ApcQ61315 2845 aa11.62□□□□□ -0.55
Nisch-201ENSMUST00000022469 NbeaQ9EPN1 2936 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 208.3 ms