RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089950.10

Rabggtb-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Rabggtb, Length 1,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Hbb-b2P02089 147 aa8.32□□□□□ -1.08
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Smim1P0C8K7 78 aa8.32□□□□□ -1.08
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Sprr1aQ62266 144 aa8.32□□□□□ -1.08
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Timm17bQ9Z0V7 172 aa8.32□□□□□ -1.08
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Trav4d-3A0A075B625 110 aa8.31□□□□□ -1.08
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Trav9d-4A0A0G2JG37 103 aa8.31□□□□□ -1.08
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 C530025M09RikF6RGA8 229 aa8.31□□□□□ -1.08
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gm17577J3QNF7 156 aa8.31□□□□□ -1.08
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Tal2Q62282 108 aa8.31□□□□□ -1.08
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 4930544G11RikQ9CR99 193 aa8.31□□□□□ -1.08
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Igkv3-2A0A075B5P0 119 aa8.3□□□□□ -1.08
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Triap1Q9D8Z2 76 aa8.3□□□□□ -1.08
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1700012A03RikQ9DAF1 130 aa8.3□□□□□ -1.08
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 TgO08710 2766 aa8.3□□□□□ -1.08
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 B230359F08RikA0A0B4J1K3 109 aa8.29□□□□□ -1.08
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gm11627A6PWP4 55 aa8.29□□□□□ -1.08
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 BB014433Q8C5R5 389 aa8.29□□□□□ -1.08
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Pgpep1Q9ESW8 209 aa8.29□□□□□ -1.08
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Igkv8-16A0A0G2JDG9 121 aa8.28□□□□□ -1.08
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 S100a8P27005 89 aa8.28□□□□□ -1.08
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Tcl1b3P56842 122 aa8.27□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gm10577Q3UDV9 132 aa8.27□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Dnah7cA0A087WR13 4024 aa8.27□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1700011M02RikB1AX35 88 aa8.26□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gm26727M0QWT1 121 aa8.26□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Defa10P50708 93 aa8.26□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Defb45Q3V490 66 aa8.26□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 SycnQ8VCK7 134 aa8.26□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Rpl24Q8BP67 157 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Dnah9B1AR51 4484 aa8.25□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 C920008G01RikA0A0B4J1N1 112 aa8.24□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gm6793B2RXM2 351 aa8.24□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ccl17F6R5P4 103 aa8.24□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gm10065F6TJM2 114 aa8.24□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Pou2af1Q64693 256 aa8.23□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Pfn2Q9JJV2 140 aa8.23□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Vps13dB1ART2 4390 aa8.23□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gm10518F6UQQ9 182 aa8.22□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Dnah11E9Q7N9 4488 aa8.22□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Trav13-2A0A075B649 110 aa8.22□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 A0A1Y7VJ07 166 aa8.22□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 A0A286YCN5 57 aa8.22□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ube2d4D3YUH6 135 aa8.22□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Glrp1E9Q9S8 174 aa8.22□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 MifP34884 115 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Cited1P97769 203 aa8.22□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Lage3Q9CR70 148 aa8.22□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Wfdc12Q9JHY3 85 aa8.22□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Reg3dQ9QUS9 175 aa8.22□□□□□ -1.09
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Plscr4P58196 326 aa8.21□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ntn5Q3UQ22 452 aa8.2□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Sostdc1Q9CQN4 206 aa8.2□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gemin7Q9CWY4 129 aa8.2□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Wfdc6bF6ULY1 148 aa8.19□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Wdr38Q9D994 303 aa8.19□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Pkd1O08852 4293 aa8.18□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Smim13E9Q942 88 aa8.18□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Cox7bP56393 80 aa8.18□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Zcchc13Q9D548 170 aa8.18□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Prol1E9PYQ4 312 aa8.17□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gm11020F6ZGD5 61 aa8.17□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Lst1O08843 95 aa8.17□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Csdc2Q91YQ3 154 aa8.17□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Cdk2ap2Q9CPY4 127 aa8.17□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 119 aa8.16□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Krtap29-1A2A5X4 342 aa8.16□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Obox2E9PXV9 151 aa8.16□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 4930415O20RikQ8CDT5 131 aa8.16□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Dnah2P0C6F1 4456 aa8.16□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Igkv8-18A0A0B4J1J3 123 aa8.15□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 BC107364E9Q5A2 140 aa8.15□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gm11027G8JL69 66 aa8.15□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 MalO09198 153 aa8.15□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Vmn1r197Q8R265 298 aa8.15□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Znf414Q9DCK4 299 aa8.15□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Slamf6Q9ET39 351 aa8.15□□□□□ -1.1
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Fam19a1Q7TPG8 133 aa8.14□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gpr15lA0A0B4J1N3 78 aa8.13□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Pglyrp4Q0VB07 374 aa8.13□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Smr3aQ61900 147 aa8.13□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Try10Q792Z1 246 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Tac4Q99N14 128 aa8.13□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gm10549Q3URY4 149 aa8.12□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Defa23Q5G866 93 aa8.12□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 A030014E15RikA0A1Y7VJV2 120 aa8.11□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Defa22Q8C1N8 93 aa8.11□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Scgb1b3J3QJY4 93 aa8.1□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 P01819 144 aa8.1□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Rab37Q9JKM7 223 aa8.1□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ighv2-2A0A075B5P8 116 aa8.1□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gm38119A0A0A6YX29 146 aa8.1□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ighv2-5A0A0A6YY69 116 aa8.1□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gm2696A0A1W2P709 240 aa8.1□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Defa27F2Z403 93 aa8.1□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gm5153P01627 120 aa8.1□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 P01821 116 aa8.1□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Rpl28P41105 137 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Rpl18aP62717 176 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Fam168bQ80XQ8 194 aa8.1□□□□□ -1.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 BC048502Q80Y74 154 aa8.1□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 62.4 ms