RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trav4d-3A0A075B625 110 aa6.76□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 C920008G01RikA0A0B4J1N1 112 aa6.76□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rpl32-psP17932 135 aa6.76□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trav9n-2A0A0G2JDP3 113 aa6.75□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ebi3O35228 228 aa6.75□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Igf1P05017 153 aa6.75□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ighv1-74A0A0G2JGK2 117 aa6.75□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dmrt3Q80WT2 476 aa6.75□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NpwA0A1L1STR8 176 aa6.75□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Igkv1-99F6XWB2 120 aa6.75□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr312Q7TRZ9 308 aa6.75□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Utp20Q5XG71 2788 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm17732E9Q5I2 61 aa6.74□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 P01811 117 aa6.74□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 SrarpQ3ULG3 163 aa6.74□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lyzl4Q9D925 145 aa6.74□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Spry2Q9QXV8 315 aa6.74□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm10337F7DEP7 55 aa6.74□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm815Q3UWS2 115 aa6.74□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Chchd5Q9CQP3 110 aa6.74□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Morn5Q9DAI9 170 aa6.74□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trav9d-3A0A075B695 113 aa6.74□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trav19A0A0B4J1K4 119 aa6.74□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm26938S4R185 226 aa6.74□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Igkv2-137A0A0B4J1H6 120 aa6.73□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 9230109A22RikQ8BHE6 111 aa6.73□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ighv1-9A0A0A6YW37 117 aa6.73□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ighv13-2A0A0A6YWN3 119 aa6.73□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rps28P62858 69 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rnf185Q91YT2 192 aa6.73□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dpm3Q9D1Q4 92 aa6.73□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 9430015G10RikA2ASP7 199 aa6.73□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm28374F6SG70 93 aa6.73□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Spink12Q9D256 87 aa6.73□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Wfdc15bQ9JHY4 80 aa6.73□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 F11rO88792 300 aa6.73□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Foxi2Q3I5G5 311 aa6.73□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfand3Q497H0 227 aa6.73□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nop10Q9CQS2 64 aa6.73□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm9195A0A140LHT4 2805 aa6.72□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trav4n-4A0A075B615 110 aa6.72□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trbv13-1A0A0B4J1P8 112 aa6.72□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 P04944 107 aa6.72□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 P06329 120 aa6.72□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gata1P17679 413 aa6.72□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ighv1-4A0A075B5T4 117 aa6.72□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Egr2P08152 470 aa6.72□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dad1P61804 113 aa6.72□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm9922Q8C3P1 144 aa6.72□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PmvkQ9D1G2 192 aa6.72□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm9958Q8C9U4 106 aa6.72□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Q9D8Q6 235 aa6.72□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Smg1Q8BKX6 3658 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Igkv4-70A0A0B4J1I5 116 aa6.71□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem243B2RVB9 118 aa6.71□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CrygeQ03740 174 aa6.71□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm12689Q8BQU9 117 aa6.71□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lelp1Q9DAE3 120 aa6.71□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 LrbaQ9ESE1 2856 aa6.71□□□□□ -1.33
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem89Q9DA04 169 aa6.71□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ighv2-7A0A075B5Q8 116 aa6.71□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ovol2Q8CIV7 274 aa6.71□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Naa38Q9D2U5 125 aa6.71□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vmo1Q5SXG7 201 aa6.7□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ighv12-3A0A075B5T1 117 aa6.7□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trdv1A0A075B657 112 aa6.7□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 P01786 117 aa6.7□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cox6cQ9CPQ1 76 aa6.7□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem263Q9DAM7 115 aa6.7□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PlaurP35456 327 aa6.7□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 H2al1aQ5M8Q2 105 aa6.7□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 9430069I07RikQ9CX21 111 aa6.7□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Igkv3-1A0A075B5P1 119 aa6.7□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm37389A0A0A6YW05 95 aa6.7□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cmc4Q61908 68 aa6.7□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 SpinklQ8CEK3 90 aa6.69□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm7102J3QQ10 178 aa6.69□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem258P61166 79 aa6.69□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 BaalcQ8VHV1 145 aa6.69□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Snai3Q9QY31 287 aa6.69□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trav14d-3-dv8A0A075B619 120 aa6.68□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf740Q6NZQ6 180 aa6.68□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Srsf12Q8C8K3 266 aa6.68□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 4930447F04RikA2AFR2 126 aa6.68□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm28038F7BCN9 126 aa6.68□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 P01738 130 aa6.68□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vpreb1P13372 142 aa6.68□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rnase1P00683 149 aa6.67□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CirbpP60824 172 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Igkv8-34A0A0G2JDU0 121 aa6.67□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm9767G3X930 207 aa6.67□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lect2O88803 151 aa6.67□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Igkv4-57-1A0A075B5M4 119 aa6.67□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm26566Q8CAC1 153 aa6.67□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ormdl2Q9CQZ0 153 aa6.67□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf580Q9DB38 172 aa6.67□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Klk11Q9QYN3 276 aa6.67□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ighv1-12A0A0A6YXJ9 117 aa6.67□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Defa28D3Z1V9 94 aa6.67□□□□□ -1.34
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 1520401A03RikA0A0J9YVH6 598 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.5 ms