RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pex7P97865 318 aa7.2□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sdhaf1Q3U276 118 aa7.2□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm9944Q8C559 102 aa7.2□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scgb3a2Q920H1 91 aa7.2□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Batf3Q9D275 118 aa7.2□□□□□ -1.26
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Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5617Q91VN2 117 aa7.19□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Srsf9Q9D0B0 222 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm4744D3Z3S5 154 aa7.18□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prp2P05143 317 aa7.18□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Med28Q920D3 178 aa7.18□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hsbp1Q9CQZ1 76 aa7.18□□□□□ -1.26
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Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm12169F2Z474 250 aa7.17□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nat8f4G5E8L3 226 aa7.17□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adcyap1O70176 175 aa7.17□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igf1P05017 153 aa7.17□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 5730596B20RikQ8BQ08 205 aa7.17□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prss58Q8BW11 241 aa7.17□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Borcs7Q9CRC6 105 aa7.17□□□□□ -1.26
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Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4930519P11RikQ9CUJ8 166 aa7.16□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igkv4-92A0A0B4J1I2 117 aa7.15□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01791 123 aa7.15□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trav3-3Q5R1C3 114 aa7.15□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr509Q8VF20 321 aa7.15□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Btf3l4Q9CQH7 158 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MobpQ9D2P8 170 aa7.15□□□□□ -1.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm10271F6WY25 52 aa7.14□□□□□ -1.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TcraP01849 138 aa7.14□□□□□ -1.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eif4ebp1Q60876 117 aa7.14□□□□□ -1.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ndufa4Q62425 82 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 9430069I07RikQ9CX21 111 aa7.14□□□□□ -1.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pdzd11Q9CZG9 140 aa7.14□□□□□ -1.27
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Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igkv3-2A0A075B5P0 119 aa7.1□□□□□ -1.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr869E9PX82 323 aa7.1□□□□□ -1.27
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Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Defa9P50707 93 aa7.1□□□□□ -1.27
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Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmsb15aA2AEH9 79 aa7.08□□□□□ -1.28
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01896 185 aa7.08□□□□□ -1.28
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SpinklQ8CEK3 90 aa7.08□□□□□ -1.28
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Anapc16Q9CPV2 110 aa7.08□□□□□ -1.28
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem223Q9CQE2 199 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm10518F6UQQ9 182 aa7.07□□□□□ -1.28
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpl39P62892 51 aa7.07□□□□□ -1.28
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm10735Q3US96 136 aa7.07□□□□□ -1.28
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4930596D02RikQ3V0H9 216 aa7.07□□□□□ -1.28
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ormdl3Q9CPZ6 153 aa7.07□□□□□ -1.28
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atxn7l1Q9CZ05 146 aa7.07□□□□□ -1.28
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trav14-3A0A075B607 120 aa7.06□□□□□ -1.28
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