RNA–Protein interactions for RNA: YPL154C

PEP4, Transcript of Vacuolar aspartyl protease (proteinase A), yeast

Gene PEP4, Length 1,218 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEP4	YPL154C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	REV1	P12689	985 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	CDC34	P14682	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	ALG1	P16661	449 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	GAC1	P28006	793 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	TFB1	P32776	642 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	UBP13	P38187	747 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	YEL076C	P39971	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	YGL176C	P46945	554 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	YAT1	P80235	687 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	SEC5	P89102	971 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	KIN3	P22209	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	TKL2	P33315	681 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	PET112	P33893	541 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	YKL151C	P36059	337 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	UTH1	P36135	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	SIF2	P38262	535 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	CHS7	P38843	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	MSS4	P38994	779 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	NUP60	P39705	539 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	OSW5	P40219	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	NUP84	P52891	726 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	RTC4	P53850	401 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	ARP5	P53946	755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	NDJ1	Q12366	352 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	HSF1	P10961	833 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	YKL107W	P34251	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	ATG12	P38316	186 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	LEU5	P38702	357 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	NPP2	P39997	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	THI6	P41835	540 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	CHA4	P43634	648 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	TOF2	Q02208	771 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	WAR1	Q03631	944 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	SEG1	Q04279	960 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	ADY4	Q05955	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	CDD1	Q06549	142 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	GPM2	Q12008	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	FOB1	O13329	566 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	SAP190	P36123	1033 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	OCA5	P38738	679 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	YHL017W	P38745	532 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	NPA3	P47122	385 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	YGR012W	P53206	393 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	TOF1	P53840	1238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	PRM6	Q04705	352 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	MDM38	Q08179	573 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	DCS2	Q12123	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEP4	YPL154C	PHO8	P11491	566 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	SFP1	P32432	683 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	YBR056W	P38081	501 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	GDH3	P39708	457 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	DAS1	P47005	663 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	EXG2	P52911	562 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	CDA1	Q06702	301 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	SRX1	P36077	127 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	AGP2	P38090	596 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	WSC4	P38739	605 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	SDS3	P40505	327 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	BUD6	P41697	788 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	ESC2	Q06340	456 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	PSK2	Q08217	1101 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	CHS1	P08004	1131 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	DSS4	P32601	143 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	SRP101	P32916	621 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	STE5	P32917	917 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	PET10	P36139	283 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	YBR225W	P38321	900 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PEP4	YPL154C	UME6	P39001	836 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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