RNA–Protein interactions for RNA: YOR328W

PDR10, Transcript of ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene PDR10, Length 4,695 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDR10	YOR328W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	PHO86	P46956	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	POL31	P46957	487 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	ALY2	P47029	1046 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
PDR10	YOR328W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	IDI1	P15496	288 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	GAL11	P19659	1081 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	CDC27	P38042	758 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	RTA1	P53047	317 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	YMR027W	Q04371	470 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	CDC73	Q06697	393 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	FRA1	Q07825	749 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	APC5	Q08683	685 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	PLC1	P32383	869 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	TCA17	P32613	152 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	YNL320W	P42840	284 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	RIM8	P53179	542 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	HST2	P53686	357 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	CRN1	Q06440	651 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	HOS1	Q12214	470 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	KAR4	P25583	335 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	SGE1	P33335	543 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	BCH2	P36122	765 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	PRM9	P39551	298 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	MGS1	P40151	587 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	EFM6	P53970	246 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	HRD3	Q05787	833 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	YPR089W	O13585	888 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	PDR1	P12383	1068 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	SSO1	P32867	290 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	YKL100C	P34248	587 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	SLX1	P38324	304 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	YEL028W	P39989	153 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	NMD5	P46970	1048 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	MPS2	P53159	387 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	RSC4	Q02206	625 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	PPM1	Q04081	328 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	SPE1	P08432	466 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	PGS1	P25578	521 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	YMC2	P38087	329 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	RIM4	P38741	713 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	VPS41	P38959	992 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	OPT1	P40897	799 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	MRPS18	P42847	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	TCB2	P48231	1178 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	YML108W	Q03759	105 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	ERV41	Q04651	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
PDR10	YOR328W	AFI1	Q99222	893 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	RBK1	P25332	333 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	ASK1	P35734	292 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	MRPL40	P36534	297 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	PEX31	P53203	462 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	PIB1	Q06651	286 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	TMA17	Q12513	150 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	INO1	P11986	533 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	PUT4	P15380	627 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	MAC1	P35192	417 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	TGL4	P36165	910 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	DSE1	P40077	573 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	ASG1	P40467	964 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	RSM7	P47150	247 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	USA1	Q03714	838 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	KRE28	Q04431	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	PGC1	Q08959	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	RGR1	P19263	1082 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61

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