RNA–Protein interactions for RNA: YOR313C

SPS4, Transcript of Protein whose expression is induced during sporulation, yeast

Gene SPS4, Length 1,017 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPS4	YOR313C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	MTF2	P10849	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	STE12	P13574	688 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	STE4	P18851	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	MCM10	P32354	571 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	SIP1	P32578	815 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	SDH8	P38345	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	SDS3	P40505	327 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	GND2	P53319	492 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	ENT1	Q12518	454 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	YLR302C	O13544	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	TMA108	P40462	946 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	IMA1	P53051	589 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	COG1	P53079	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	CBK1	P53894	756 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	TRM8	Q12009	286 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	ERP2	P39704	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	MNT3	P40549	630 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	USA1	Q03714	838 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	VID22	Q05934	901 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	OPY2	Q06810	360 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	SUL2	Q12325	893 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	PDE1	P22434	369 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	YCR061W	P25639	631 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	UBS1	P38290	277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	RIC1	P40395	1056 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	BST1	P43571	1029 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	CTF18	P49956	741 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	COQ6	P53318	479 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	UBP16	Q02863	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	CRT10	Q08226	957 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPS4	YOR313C	WHI2	P12611	486 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	CDC5	P32562	705 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	MTH1	P35198	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	UBX6	P47049	396 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	TMN2	Q04562	672 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	STP3	Q05937	343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	AAC1	P04710	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	TPK2	P06245	380 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	YMC2	P38087	329 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	TDP1	P38319	544 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	YER010C	P40011	234 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	MAM1	P40065	302 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	LAS21	P40367	830 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	TAM41	P53230	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	WAR1	Q03631	944 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	YML053C	Q04978	212 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	TAF3	Q12297	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	PCD1	Q12524	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	SPO11	P23179	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	RPN12	P32496	274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	AXL2	P38928	823 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	YEL068C	P39977	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	STU2	P46675	888 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	BNA1	P47096	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	COG2	P53271	262 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	MEP3	P53390	489 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	NBP2	Q12163	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	MUP3	P38734	546 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	YML119W	Q03208	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	SNO4	Q04902	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	COG4	Q06096	861 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	TMA16	Q08687	178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	HSP32	Q08992	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	SWT1	Q12104	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	BIK1	P11709	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	SPO16	P17122	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	URK1	P27515	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	MIT1	P40002	666 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPS4	YOR313C	ASE1	P50275	885 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 39.2 ms