RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	NFS1	P25374	497 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	DBF4	P32325	704 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	GYP6	P32806	458 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	SWE1	P32944	819 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	EMC3	P36039	253 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	YBR062C	P38239	180 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	MSG5	P38590	489 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	MMS21	P38632	267 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	SAK1	P38990	1142 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	GPB2	P39717	880 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	MRX1	P40050	688 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	ASG1	P40467	964 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	DSN1	P40568	576 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	PXA1	P41909	870 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	GYP8	P43570	497 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	CPR7	P47103	393 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	YGR111W	P53265	400 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	SEY1	Q99287	776 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	ADH4	P10127	382 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	CBF1	P17106	351 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	PER1	P25625	357 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	YCR051W	P25631	222 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	PCL2	P25693	308 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	PRO1	P32264	428 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	COT1	P32798	439 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	TFC4	P33339	1025 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	CSG2	P35206	410 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	YRO2	P38079	344 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	REG2	P38232	338 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	YSW1	P38280	609 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	VHC1	P38329	1120 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	DSS1	P39112	969 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	SPC72	P39723	622 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	NPP2	P39997	493 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	INA22	P40576	216 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	CAF16	P43569	289 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	YJL045W	P47052	634 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	ORC5	P50874	479 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	ALT1	P52893	592 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	ENV11	P53246	860 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	RTT102	P53330	157 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	ADA2	Q02336	434 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	ATG16	Q03818	150 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	PPM1	Q04081	328 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	UFO1	Q04511	668 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	YLR278C	Q05854	1341 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	IES4	Q08561	116 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	ENV7	Q12003	364 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	ERP3	Q12403	225 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	SPO16	P17122	198 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	CDC42	P19073	191 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	ARG1	P22768	420 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	RNQ1	P25367	405 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	EUG1	P32474	517 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	YSC84	P32793	468 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	OCT1	P35999	772 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	YFL054C	P43549	646 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	PHO86	P46956	311 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	YNL146W	P53906	100 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	COG6	P53959	839 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	SLD5	Q03406	294 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	SMC5	Q08204	1093 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	HIF1	Q12373	385 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	NCA2	Q12374	616 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TRS33	YOR115C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	RAD10	P06838	210 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	PEP5	P12868	1029 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	PMR1	P13586	950 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	RRT12	P25381	491 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	SWI3	P32591	825 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	YME1	P32795	747 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	SEC6	P32844	805 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	REC104	P33323	182 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	GPT2	P36148	743 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	YBP1	P38315	674 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	EAF5	P39995	279 aa		5.08	□□□□□ -1.6

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