RNA–Protein interactions for RNA: YNL233W

BNI4, Transcript of Targeting subunit for Glc7p protein phosphatase, yeast

Gene BNI4, Length 2,679 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BNI4	YNL233W	PEX25	Q02969	394 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	NGL3	Q03210	505 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	AIM32	Q04689	311 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	YLR345W	Q06137	509 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	SUL2	Q12325	893 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	POM34	Q12445	299 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	ESP1	Q03018	1630 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	STF1	P01098	86 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	AI3	P03877	415 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	STE50	P25344	346 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	ADK2	P26364	225 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	TDP1	P38319	544 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	YHR112C	P38716	378 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	SSU1	P41930	458 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	SKP2	P42843	763 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	ASE1	P50275	885 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	SGF73	P53165	657 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	BUD9	P53226	547 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	AIM6	Q07716	390 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	ECM3	Q99252	613 aa		3.21	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	ERG8	P24521	451 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	CLB3	P24870	427 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	REG2	P38232	338 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	PSD1	P39006	500 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	LCB2	P40970	561 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	SAE2	P46946	345 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	AAD10	P47182	288 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	YDL183C	P48569	320 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	VTI1	Q04338	217 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	MET22	P32179	357 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	PUP2	P32379	260 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	STE14	P32584	239 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	STB6	P36085	766 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	ALY1	P36117	915 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	SRO77	P38163	1010 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	3.2	□□□□□ -1.9	not detected
BNI4	YNL233W	RTS1	P38903	757 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.2	□□□□□ -1.9	not detected
BNI4	YNL233W	FTR1	P40088	404 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	YNR014W	P53719	212 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	GRX6	Q12438	231 aa		3.2	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	TUP1	P16649	713 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	GCS1	P35197	352 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	UBP11	P36026	717 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	STB5	P38699	743 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	GLO1	P50107	326 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	GAD1	Q04792	585 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	TPO1	Q07824	586 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	TMA16	Q08687	178 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	RIM20	Q12033	661 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	VCX1	Q99385	411 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	YRF1-4	O13559	1382 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	GAL10	P04397	699 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	CHS2	P14180	963 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	REC107	P21651	314 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	CLB1	P24868	471 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	MSS4	P38994	779 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	MET18	P40469	1032 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	IDS2	P46958	469 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	FDC1	Q03034	503 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	NRG1	Q03125	231 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	GYL1	Q04322	720 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	IRC20	Q06554	1556 aa		3.19	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	EHT1	P38295	451 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	SMF1	P38925	575 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	SLZ1	P40167	298 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	RGI2	P40188	164 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	TAM41	P53230	385 aa		3.18	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.3 ms