RNA–Protein interactions for RNA: Q0060

AI3, Transcript of Endonuclease I-SceIII, yeast

Gene AI3, Length 1,248 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI3	Q0060	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	YML053C	Q04978	212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	LCB4	Q12246	624 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	AEP2	P22136	580 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	MET30	P39014	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	YGL260W	P53056	76 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	PLM2	Q04383	521 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	MLH2	Q07980	695 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	YOR378W	Q08902	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AI3	Q0060	CBP3	P21560	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	CWH43	P25618	953 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	IRC5	P43610	853 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	YNL058C	P53947	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	NUP145	P49687	1317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	PLC1	P32383	869 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	GRS2	Q06817	618 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	LAS21	P40367	830 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	YPT11	P48559	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	MNT2	P53059	558 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	VTC3	Q02725	835 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	RRI1	Q12468	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	VPS5	Q92331	675 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	MAM1	P40065	302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	PEA2	P40091	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	YIL169C	P40442	995 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	ACS1	Q01574	713 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	CNA1	P23287	553 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	RAD26	P40352	1085 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	PMT3	P47190	753 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	YDL242W	Q07746	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	YPR027C	Q12079	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	URA3	P03962	267 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	UBP7	P40453	1071 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	EAF5	P39995	279 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
AI3	Q0060	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	YJL107C	P42947	387 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	AAT1	Q01802	451 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	GSH1	P32477	678 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	GSH2	Q08220	491 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	RTT107	P38850	1070 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	YNL144C	P53907	740 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	SKY1	Q03656	742 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	YAT1	P80235	687 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	MAD2	P40958	196 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	YJR142W	P47173	342 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	YGR237C	P50089	785 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	ORC5	P50874	479 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	YNR071C	P53757	342 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	DIN7	Q12086	430 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	HOS1	Q12214	470 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	LNP1	P38878	278 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	SAD1	P43589	448 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	IDS2	P46958	469 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
AI3	Q0060	YOX1	P34161	385 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AI3	Q0060	GSM1	P42950	618 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AI3	Q0060	RTT103	Q05543	409 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AI3	Q0060	YND1	P40009	630 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AI3	Q0060	BET4	Q00618	327 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AI3	Q0060	RMP1	Q12530	201 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AI3	Q0060	YCR061W	P25639	631 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AI3	Q0060	PPZ1	P26570	692 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AI3	Q0060	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
AI3	Q0060	SDS24	P38314	527 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AI3	Q0060	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
AI3	Q0060	ARN1	P38731	627 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AI3	Q0060	VRG4	P40107	337 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AI3	Q0060	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AI3	Q0060	NIC96	P34077	839 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AI3	Q0060	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
AI3	Q0060	CRF1	Q04930	467 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AI3	Q0060	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
AI3	Q0060	PTC6	P25646	442 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AI3	Q0060	YPR003C	P53394	754 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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