RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 OGFOD1Q8N543 542 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 IDI2Q9BXS1 227 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 PFKFB2O60825 505 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 PRDM1O75626 825 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 NT5C2P49902 561 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 GTF3C6Q969F1 213 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 LIFRP42702 1097 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 NFIAQ12857 509 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 STK3Q13188 491 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 DYNLL2Q96FJ2 89 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 NPM3O75607 178 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM67Q5HYA8 995 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 LY9Q9HBG7 655 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 BRPF3Q9ULD4 1205 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 SPDYE2BA6NHP3 402 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 SPDYE6P0CI01 402 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF6P56537 245 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 SART3Q15020 963 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 SGMS1Q86VZ5 419 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 MTMR14Q8NCE2 650 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS12P25398 132 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 MMP14P50281 582 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 C16orf86Q6ZW13 317 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC6Q86TZ1 520 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 LMNB1P20700 586 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 SCRN1Q12765 414 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 DLGAP5Q15398 846 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 SENP2Q9HC62 589 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM198AQ9UFP1 575 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 CACNB3P54284 484 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 UBAC1Q9BSL1 405 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF287Q9HBT7 754 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 SBF1O95248 1867 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ERICH2A1L162 156 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 SEC23AQ15436 765 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 SMC3Q9UQE7 1217 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP29.23■■■□□ 2.274e-7■■■□□ 18.5
CAPNS1-215ENST00000628018 CDK8P49336 464 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 WTAPQ15007 396 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 IQCA1Q86XH1 822 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 TMTC2Q8N394 836 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC44A5Q8NCS7 719 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 MKNK2Q9HBH9 465 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 HPS5Q9UPZ3 1129 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 TNKSO95271 1327 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 GABPAQ06546 454 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM47AQ5JRC9 791 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFPM1Q8IX07 1006 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 DPF2Q92785 391 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ENTPD3O75355 529 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 RASA1P20936 1047 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 APOA5Q6Q788 366 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF541Q9H0D2 1346 aa29.2■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPY2A6NKD2 308 aa29.2■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA8BA8MQT2 603 aa29.2■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 CCT2P78371 535 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 NUCB2P80303 420 aa29.2■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 NFXL1Q6ZNB6 911 aa29.2■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 CHMP4CQ96CF2 233 aa29.2■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC69A6NI79 296 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 GJB2P29033 226 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 TFAP4Q01664 338 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 TCP10Q12799 353 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB3GAP1Q15042 981 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 MYOZ2Q9NPC6 264 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 HLA-DOAP06340 250 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 SPDYE2Q495Y8 402 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 EHD4Q9H223 541 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 TMOD2Q9NZR1 351 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINB13Q9UIV8 391 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 GJA3Q9Y6H8 435 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 SHTN1A0MZ66 631 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC12A7Q9Y666 1083 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 SIPA1L1O43166 1804 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ATRNL1Q5VV63 1379 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 CTDNEP1O95476 244 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 PKP1Q13835 747 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms