RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597474.5

FCHO1-220, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-220ENST00000597474 MTX1Q13505 466 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 IRF5Q13568 498 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 MVPQ14764 893 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 HTATIP2Q9BUP3 242 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 AKAP2Q9Y2D5 859 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 TBC1D12O60347 775 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 PXYLP1Q8TE99 480 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 NEUROD6Q96NK8 337 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 DEFB118Q96PH6 123 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 FAM110CQ1W6H9 321 aa16.05■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 SPATA5Q8NB90 893 aa16.05■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 TAOK2Q9UL54 1235 aa16.05■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 TNNQ9UQP3 1299 aa16.05■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 MYH1P12882 1939 aa16.04■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 GNAI3P08754 354 aa16.04■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 SPP2Q13103 211 aa16.04■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 TFRCP02786 760 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 CAP2P40123 477 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 MCAMP43121 646 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 HMGCS2P54868 508 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF280CQ8ND82 737 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 ARHGAP45Q92619 1136 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 COA7Q96BR5 231 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 RAI14Q9P0K7 980 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 PNMA3Q9UL41 463 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 NR2E3Q9Y5X4 410 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 LDHCP07864 332 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 GSTO1P78417 241 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 TEX11Q8IYF3 940 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 FRMPD3Q5JV73 1810 aa16.02■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 TRIM27P14373 513 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 GORABQ5T7V8 394 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 USP17L5A8MUK1 530 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 EVI5O60447 810 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 JAG1P78504 1218 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 TRIM32Q13049 653 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 SH3D19Q5HYK7 790 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 GJD2Q9UKL4 321 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 PEX10O60683 326 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 GNAI2P04899 355 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 ADGRA1Q86SQ6 560 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 TBC1D2Q9BYX2 928 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 DNAJC18Q9H819 358 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 SNRKQ9NRH2 765 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 LRP2BPQ9P2M1 347 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 HMGCRP04035 888 aa15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 MTMR2Q13614 643 aa15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 MORF4L1Q9UBU8 362 aa15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 STAP2Q9UGK3 403 aa15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 BCAR3O75815 825 aa15.97■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 CAPN2P17655 700 aa15.97■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa15.97■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 NECAB2Q7Z6G3 386 aa15.97■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa15.97■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 TRIB2Q92519 343 aa15.97■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 CLUAP1Q96AJ1 413 aa15.97■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 DBNDD2Q9BQY9 259 aa15.97■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 WDR18Q9BV38 432 aa15.97■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 PI4KBQ9UBF8 816 aa15.97■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 FLT1P17948 1338 aa15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 A0A1W2PPC1 479 aa15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 LRCH3Q96II8 777 aa15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 AS3MTQ9HBK9 375 aa15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 TXNRD2Q9NNW7 524 aa15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-220ENST00000597474 RPTORQ8N122 1335 aa15.95■□□□□ 0.14
FCHO1-220ENST00000597474 UNC80Q8N2C7 3258 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms