RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 F8W735 103 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 XYLBO75191 536 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 RGL4Q8IZJ4 473 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.57□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 TCP11L2Q8N4U5 519 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 MYO19Q96H55 970 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 C11orf16Q9NQ32 467 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 UTRNP46939 3433 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 WDR17Q8IZU2 1322 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 MMP20O60882 483 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 TRIM37O94972 964 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 IL22RA1Q8N6P7 574 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 KCNMB2Q9Y691 235 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 BCL9O00512 1426 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 NHSQ6T4R5 1651 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 TMEM88BA6NKF7 163 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 EGFRP00533 1210 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 SCNN1AP37088 669 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 SIK1P57059 783 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 EVA1CP58658 441 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 SETDB1Q15047 1291 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 TREML1Q86YW5 311 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 CASZ1Q86V15 1759 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 KIF20BQ96Q89 1820 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 PSAPP07602 524 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 FBLN1P23142 703 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 Q6ZS46 218 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 PAPPAQ13219 1627 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 MED26O95402 600 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 GHRHP01286 108 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 GLB1P16278 677 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 CD97P48960 835 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 KCNH5Q8NCM2 988 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 USP47Q96K76 1375 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 TNS2Q63HR2 1409 aa7.52□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 BTAF1O14981 1849 aa7.52□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 PARD3Q8TEW0 1356 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 COX20Q5RI15 118 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 TMC1Q8TDI8 760 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 NINLQ9Y2I6 1382 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 WISP1O95388 367 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 ATP2B4P23634 1241 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 PDE3BQ13370 1112 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 DDB1Q16531 1140 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 CCDC7Q96M83 1385 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 BTBD11A6QL63 1104 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 FYB1O15117 783 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 KCNQ2O43526 872 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 SOX18P35713 384 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 FAM26DQ5JW98 314 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 RAXQ9Y2V3 346 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 MAP3K19Q56UN5 1328 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 COL24A1Q17RW2 1714 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 DOT1LQ8TEK3 1739 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 MEGF6O75095 1541 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 PLSCR1O15162 318 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 TGFB1P01137 390 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC3-212ENST00000597259 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms