RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPTLC2O15270 562 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLFN14P0C7P3 912 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 NDUFA8P51970 172 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 CYB5R4Q7L1T6 521 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 CEP57L1Q8IYX8 460 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A087WWV3 80 aa23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF28PB7ZC32 967 aa23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 PDE6AP16499 860 aa23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 TGFB2P61812 414 aa23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERO1AQ96HE7 468 aa23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 SDF4Q9BRK5 362 aa23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa23.45■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 APPP05067 770 aa23.45■■□□□ 1.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.45■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.45■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.45■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 FGFR2P21802 821 aa23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCNA3P22001 575 aa23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCNJ6P48051 423 aa23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANO1Q5XXA6 986 aa23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 KRT222Q8N1A0 295 aa23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 LPIN2Q92539 896 aa23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCZ1BP86790 482 aa23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDKL5O76039 1030 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 TUBB4AP04350 444 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIAA1468Q9P260 1216 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 NEDD4P46934 1319 aa23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 PDE6BP35913 854 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 GSDMDP57764 484 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 PTPN14Q15678 1187 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 ALX1Q15699 326 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 APOA5Q6Q788 366 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 AOPEPQ8N6M6 819 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM87BQ96K49 555 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 B4E1Z4 1266 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 AIDAQ96BJ3 306 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 ALG1Q9BT22 464 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 CACNA1SQ13698 1873 aa23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 H0YIN7 160 aa23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 TERF2Q15554 542 aa23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 IMPACTQ9P2X3 320 aa23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 LAMB2P55268 1798 aa23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 AIFM3Q96NN9 605 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 SKILP12757 684 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 CMA1P23946 247 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDC27P30260 824 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 KMT5BQ4FZB7 885 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPATA5Q8NB90 893 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 BPIFA3Q9BQP9 254 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 L2HGDHQ9H9P8 463 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 SENP2Q9HC62 589 aa23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF202O95125 648 aa23.39■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC5A1P13866 664 aa23.39■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.341e-6■□□□□ 9
CCNDBP1-205ENST00000564630 RXRAP19793 462 aa23.39■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 FBXW7Q969H0 707 aa23.39■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC39A14Q15043 492 aa23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPR162Q16538 588 aa23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 KRT40Q6A162 431 aa23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 LY9Q9HBG7 655 aa23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 BCS1LQ9Y276 419 aa23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZBTB43O43298 467 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 SRGNP10124 158 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 PFKFB1P16118 471 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 DPCR1Q3MIW9 517 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 MICU3Q86XE3 530 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 VPS37DQ86XT2 251 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC69A6NI79 296 aa23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLU7O95391 586 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
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