RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553786.1

PRRX1-208, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PRRX1, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-208ENST00000553786 SPP2Q13103 211 aa20.73■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.73■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.73■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 A0A1W2PPC1 479 aa20.72■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 LDHCP07864 332 aa20.72■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 HMGCS2P54868 508 aa20.72■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.72■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 GORABQ5T7V8 394 aa20.72■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 PI16Q6UXB8 463 aa20.72■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 SPATA5Q8NB90 893 aa20.72■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.72■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.72■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.72■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 HMGCRP04035 888 aa20.71■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 GNAI3P08754 354 aa20.71■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 RAI14Q9P0K7 980 aa20.71■□□□□ 0.91
PRRX1-208ENST00000553786 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.7■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 CAP2P40123 477 aa20.7■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 MTX1Q13505 466 aa20.7■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.7■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.7■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 USP17L5A8MUK1 530 aa20.69■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 TEX11Q8IYF3 940 aa20.69■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 STAP2Q9UGK3 403 aa20.69■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.68■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 LAMA3Q16787 3333 aa20.68■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 ANKLE1Q8NAG6 615 aa20.67■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 LRP2BPQ9P2M1 347 aa20.67■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.66■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 C7orf61Q8IZ16 206 aa20.66■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 GJD2Q9UKL4 321 aa20.66■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 RPTORQ8N122 1335 aa20.66■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 MCAMP43121 646 aa20.65■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 TRIM32Q13049 653 aa20.65■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 MTMR2Q13614 643 aa20.65■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.65■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 LRCH3Q96II8 777 aa20.65■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.65■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.64■□□□□ 0.9
PRRX1-208ENST00000553786 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.64■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 NBPF3Q9H094 633 aa20.64■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.64■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 PI4KBQ9UBF8 816 aa20.64■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.63■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 BAG3O95817 575 aa20.63■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 ASNSP08243 561 aa20.63■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.63■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 TRIB2Q92519 343 aa20.63■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 GDF15Q99988 308 aa20.63■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 WDR18Q9BV38 432 aa20.63■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 GNAI2P04899 355 aa20.62■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 PLCG2P16885 1265 aa20.62■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 BACE1P56817 501 aa20.62■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 SOCS4Q8WXH5 440 aa20.62■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.62■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.62■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 ALPK3Q96L96 1907 aa20.62■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.61■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 CYP2B6P20813 491 aa20.61■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.61■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 SNRKQ9NRH2 765 aa20.61■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.61■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 FLT1P17948 1338 aa20.6■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 BMP8BP34820 402 aa20.6■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 HERVK_113P62684 666 aa20.6■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 PDE3AQ14432 1141 aa20.6■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.6■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.6■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.6■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.6■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 DNAJC18Q9H819 358 aa20.6■□□□□ 0.89
PRRX1-208ENST00000553786 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms