RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 TTLL4Q14679 1199 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 MAP3K11Q16584 847 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 BCL11AQ9H165 835 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.1□□□□□ -1.435e-7■■■■■ 27.7
PTPRC-214ENST00000530727 LRP8Q14114 963 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 CRELD1Q96HD1 420 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 PICK1Q9NRD5 415 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 F13BP05160 661 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 CTSHP09668 335 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 SSTR4P31391 388 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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PTPRC-214ENST00000530727 ZAR1Q86SH2 424 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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PTPRC-214ENST00000530727 GRIN2BQ13224 1484 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 COBLO75128 1261 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 ADMP35318 185 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 GRIK1P39086 918 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 ARTNQ5T4W7 220 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 ADAMTS12P58397 1594 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 USP31Q70CQ4 1352 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 PRR19A6NJB7 356 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 LIG3P49916 1009 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 PPM1JQ5JR12 505 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 SHISA5Q8N114 240 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 RNF214Q8ND24 703 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 UNCXA6NJT0 531 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 RLBP1P12271 317 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRC-214ENST00000530727 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRC-214ENST00000530727 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRC-214ENST00000530727 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 FAM170BA6NMN3 283 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 NEFMP07197 916 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.07□□□□□ -1.44
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PTPRC-214ENST00000530727 ISL2Q96A47 359 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 FHAD1B1AJZ9 1412 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 CD97P48960 835 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 CYP27A1Q02318 531 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 CDK5R2Q13319 367 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 SEPT6Q14141 434 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 CLIP1P30622 1438 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 HDXQ7Z353 690 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 FANCGO15287 622 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 INPP5AQ14642 412 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 NBPF11Q86T75 865 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 F6X3S4 739 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 CYP26A1O43174 497 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 MED26O95402 600 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 FOSL1P15407 271 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 ARAP1Q96P48 1450 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 FAM87AP0C7U9 286 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
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