RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 NEDD4P46934 1319 aa26.99■■□□□ 1.91
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TSNARE1-208ENST00000524325 SULF1Q8IWU6 871 aa26.99■■□□□ 1.91
TSNARE1-208ENST00000524325 TOMM22Q9NS69 142 aa26.99■■□□□ 1.91
TSNARE1-208ENST00000524325 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa26.99■■□□□ 1.91
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJC18Q9H819 358 aa26.98■■□□□ 1.91
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TSNARE1-208ENST00000524325 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa26.96■■□□□ 1.91
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TSNARE1-208ENST00000524325 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
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TSNARE1-208ENST00000524325 STAG1Q8WVM7 1258 aa26.95■■□□□ 1.91
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TSNARE1-208ENST00000524325 TSGA10IPQ3SY00 556 aa26.94■■□□□ 1.9
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.94■■□□□ 1.9
TSNARE1-208ENST00000524325 C16orf86Q6ZW13 317 aa26.94■■□□□ 1.9
TSNARE1-208ENST00000524325 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.93■■□□□ 1.9
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.98e-6■■■□□ 18.6
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TSNARE1-208ENST00000524325 CASTP20810 708 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
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TSNARE1-208ENST00000524325 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.91e-6■■■■□ 26.4
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TSNARE1-208ENST00000524325 ROBO3Q96MS0 1386 aa26.92■■□□□ 1.9
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TSNARE1-208ENST00000524325 CYB5R4Q7L1T6 521 aa26.91■■□□□ 1.9
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TSNARE1-208ENST00000524325 RASA1P20936 1047 aa26.9■■□□□ 1.9
TSNARE1-208ENST00000524325 CDCA5Q96FF9 252 aa26.9■■□□□ 1.9
TSNARE1-208ENST00000524325 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa26.9■■□□□ 1.9
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
TSNARE1-208ENST00000524325 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
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TSNARE1-208ENST00000524325 FGRP09769 529 aa26.89■■□□□ 1.9
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TSNARE1-208ENST00000524325 ZSWIM5Q9P217 1185 aa26.89■■□□□ 1.9
TSNARE1-208ENST00000524325 GDF11O95390 407 aa26.89■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 JAG1P78504 1218 aa26.89■■□□□ 1.89
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TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 ORC4O43929 436 aa26.87■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa26.87■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 MOB2Q70IA6 237 aa26.87■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.87■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 SIPA1L1O43166 1804 aa26.86■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 KRT23Q9C075 422 aa26.86■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 SWAP70Q9UH65 585 aa26.86■■□□□ 1.89
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