RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 SNX21Q969T3 373 aa18.35■□□□□ 0.53
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TRPS1-206ENST00000517323 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
TRPS1-206ENST00000517323 TPCN1Q9ULQ1 816 aa18.35■□□□□ 0.53
TRPS1-206ENST00000517323 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
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TRPS1-206ENST00000517323 SHMT1P34896 483 aa18.27■□□□□ 0.51
TRPS1-206ENST00000517323 RASA3Q14644 834 aa18.27■□□□□ 0.51
TRPS1-206ENST00000517323 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
TRPS1-206ENST00000517323 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
TRPS1-206ENST00000517323 MTMR7Q9Y216 660 aa18.27■□□□□ 0.51
TRPS1-206ENST00000517323 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
TRPS1-206ENST00000517323 AKR1B1P15121 316 aa18.26■□□□□ 0.51
TRPS1-206ENST00000517323 JAG1P78504 1218 aa18.26■□□□□ 0.51
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