RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514472.1

FGFR4-216, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

TSL 4

Gene FGFR4, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4-216ENST00000514472 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.38■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 PCDH10Q9P2E7 1040 aa27.38■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 PRKCZQ05513 592 aa27.37■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 CCDC158Q5M9N0 1113 aa27.37■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa27.37■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 RLBP1P12271 317 aa27.36■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 GABRQQ9UN88 632 aa27.36■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 CAP2P40123 477 aa27.35■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 PPP4CP60510 307 aa27.35■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 MIER1Q8N108 512 aa27.35■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 SHISA4Q96DD7 197 aa27.35■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 SPP2Q13103 211 aa27.34■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 TREML2Q5T2D2 321 aa27.34■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP27.34■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 BAG3O95817 575 aa27.33■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 ADGRA1Q86SQ6 560 aa27.33■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.33■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 ZNF280CQ8ND82 737 aa27.33■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 TBC1D2Q9BYX2 928 aa27.33■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 PI4KBQ9UBF8 816 aa27.33■■□□□ 1.97
FGFR4-216ENST00000514472 MYH1P12882 1939 aa27.32■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 IGSF3O75054 1194 aa27.32■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 CCL5P13501 91 aa27.32■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 PLCG2P16885 1265 aa27.32■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 SLAIN1Q8ND83 568 aa27.32■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 GJB1P08034 283 aa27.31■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 ZAP70P43403 619 aa27.31■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa27.31■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 USP17L5A8MUK1 530 aa27.3■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 GJA8P48165 433 aa27.3■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 FLT3LGP49771 235 aa27.3■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 SH3D19Q5HYK7 790 aa27.3■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 NKX2-3Q8TAU0 364 aa27.3■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 PNMA3Q9UL41 463 aa27.3■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 ADCY3O60266 1144 aa27.29■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 UBXN2AP68543 259 aa27.29■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa27.29■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 FLT1P17948 1338 aa27.29■■□□□ 1.96
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FGFR4-216ENST00000514472 HMGCS2P54868 508 aa27.28■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 IRF5Q13568 498 aa27.28■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 FAM110CQ1W6H9 321 aa27.28■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa27.28■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa27.28■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 RNF208Q9H0X6 261 aa27.28■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 DNAJC18Q9H819 358 aa27.28■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa27.27■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 CEP85Q6P2H3 762 aa27.27■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 PXYLP1Q8TE99 480 aa27.27■■□□□ 1.96
FGFR4-216ENST00000514472 JAG1P78504 1218 aa27.26■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 WDR18Q9BV38 432 aa27.26■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 AS3MTQ9HBK9 375 aa27.26■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 PALD1Q9ULE6 856 aa27.26■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 UNC93B1Q9H1C4 597 aa27.25■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 PLXNB2O15031 1838 aa27.25■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 ASNSP08243 561 aa27.24■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 ELNP15502 786 aa27.24■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP27.24■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 H0YGN5 161 aa27.23■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 BACE1P56817 501 aa27.23■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 COA7Q96BR5 231 aa27.23■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.22■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 INHAP05111 366 aa27.22■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 CYP7A1P22680 504 aa27.22■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 GINM1Q9NU53 330 aa27.22■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 IDH1O75874 414 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 SGPL1O95470 568 aa27.21■■□□□ 1.95
FGFR4-216ENST00000514472 MTMR2Q13614 643 aa27.21■■□□□ 1.95
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