RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 LDHCP07864 332 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 MTX1Q13505 466 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 GSTO1P78417 241 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 IRF5Q13568 498 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 COA7Q96BR5 231 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRN-217ENST00000489650 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 MCAMP43121 646 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 HMGCS2P54868 508 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 TEX11Q8IYF3 940 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 PNMA3Q9UL41 463 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 CAP2P40123 477 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 SNRKQ9NRH2 765 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 GNAI2P04899 355 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 PRO3102Q9H379 93 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 USP17L5A8MUK1 530 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 EVI5O60447 810 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 TRIM27P14373 513 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 BCAR3O75815 825 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 PEX10O60683 326 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 JAG1P78504 1218 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 TRIM32Q13049 653 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 SIPA1L1O43166 1804 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 ALPK3Q96L96 1907 aa22.7■■□□□ 1.23
PTPRN-217ENST00000489650 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 GJD2Q9UKL4 321 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 MTMR2Q13614 643 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 STAP2Q9UGK3 403 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 BAG3O95817 575 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 PLXNB2O15031 1838 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 HMGCRP04035 888 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 TNNI3KQ59H18 835 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 WDR18Q9BV38 432 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 DNAJC18Q9H819 358 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 PALD1Q9ULE6 856 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 GDF11O95390 407 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 CAPN2P17655 700 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 CYP2B6P20813 491 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 BACE1P56817 501 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 RPTORQ8N122 1335 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 PPP4CP60510 307 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
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