RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 USP17L7P0C7H9 530 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 TTLL4Q14679 1199 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF765Q7L2R6 523 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 GPBAR1Q8TDU6 330 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 GATA6Q92908 595 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 FAM8A1Q9UBU6 413 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 CLIP1P30622 1438 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-211ENST00000484135 ENC1O14682 589 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 CDK5R2Q13319 367 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 MSMPQ1L6U9 139 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 PICK1Q9NRD5 415 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 DISC1Q9NRI5 854 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 ERCC6L2Q5T890 1561 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 FHOD3Q2V2M9 1422 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 ADAMTS4O75173 837 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 PAGE1O75459 146 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 JAG1P78504 1218 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 CELA3AP09093 270 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 FAM87AP0C7U9 286 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 GNA15P30679 374 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 ERVK-24P63145 666 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 FGD1P98174 961 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC14Q15048 493 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 FRMD6Q96NE9 622 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 CSADQ9Y600 493 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM37O94972 964 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 BMP6P22004 513 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 ISL2Q96A47 359 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 DISP1Q96F81 1524 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 UGGT2Q9NYU1 1516 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 ARAP1Q96P48 1450 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 NEFMP07197 916 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 RNF214Q8ND24 703 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHA4Q9UN74 947 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA0556O60303 1618 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 SHROOM2Q13796 1616 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 SAMD9Q5K651 1589 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 COL19A1Q14993 1142 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 PPM1JQ5JR12 505 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 OGFOD2Q6N063 350 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 FLCNQ8NFG4 579 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 ELMO3Q96BJ8 720 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 PRNPP04156 253 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 LMNB1P20700 586 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 RASIP1Q5U651 963 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 SV2BQ7L1I2 683 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 FBXL18Q96ME1 805 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 PTPRGP23470 1445 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 CYB5RLQ6IPT4 315 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 C12orf40Q86WS4 652 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 ASIC4Q96FT7 647 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 EFCAB5A4FU69 1503 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 LEFTY1O75610 366 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 TTBK2Q6IQ55 1244 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 ABI1Q8IZP0 508 aa7.3□□□□□ -1.24
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