RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 MECOMQ03112 1051 aa6.63□□□□□ -1.35
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PTPRC-210ENST00000462363 SBK1Q52WX2 424 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 CAVIN4Q5BKX8 364 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC183Q5T5S1 534 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 ATL3Q6DD88 541 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 FERMT3Q86UX7 667 aa6.63□□□□□ -1.35
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PTPRC-210ENST00000462363 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
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PTPRC-210ENST00000462363 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
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PTPRC-210ENST00000462363 KIF28PB7ZC32 967 aa6.61□□□□□ -1.35
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PTPRC-210ENST00000462363 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.6□□□□□ -1.35
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PTPRC-210ENST00000462363 SP8Q8IXZ3 490 aa6.6□□□□□ -1.35
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PTPRC-210ENST00000462363 ANKS1AQ92625 1134 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 AIFM3Q96NN9 605 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 CD209Q9NNX6 404 aa6.6□□□□□ -1.35
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