RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 ABCF2Q9UG63 623 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 TBC1D12O60347 775 aa14.35□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 LDHCP07864 332 aa14.35□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 PHKA1P46020 1223 aa14.35□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 CCDC102BQ68D86 513 aa14.35□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 PTPRFP10586 1907 aa14.35□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.34□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 LAMA3Q16787 3333 aa14.34□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 HMGCRP04035 888 aa14.34□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 SLURP2P0DP57 97 aa14.34□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 BTDP43251 543 aa14.34□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 PICALMQ13492 652 aa14.34□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 ERICH6Q7L0X2 663 aa14.34□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.34□□□□□ -0.11
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PRAME-210ENST00000442481 AS3MTQ9HBK9 375 aa14.34□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 COPRSQ9NQ92 184 aa14.34□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 STAP2Q9UGK3 403 aa14.34□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa14.34□□□□□ -0.11
PRAME-210ENST00000442481 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 MS4A1P11836 297 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 GPR153Q6NV75 609 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 ZNF280CQ8ND82 737 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
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PRAME-210ENST00000442481 ALPK3Q96L96 1907 aa14.33□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 RASGRF1Q13972 1273 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 NBPF3Q9H094 633 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.32□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 RPTORQ8N122 1335 aa14.32□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 BMP8BP34820 402 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 GORABQ5T7V8 394 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 COG6Q9Y2V7 657 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GUL7 405 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 USP17L5A8MUK1 530 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 MECOMQ03112 1051 aa14.3□□□□□ -0.12
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PRAME-210ENST00000442481 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 SOCS4Q8WXH5 440 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 PLCG2P16885 1265 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 ADORA1P30542 326 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 MTX1Q13505 466 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 PDE3AQ14432 1141 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 TREML2Q5T2D2 321 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 GINM1Q9NU53 330 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 IGSF3O75054 1194 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 BAG3O95817 575 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 ASNSP08243 561 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 CAP2P40123 477 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 HMGCS2P54868 508 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 TIMM10P62072 90 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 TFCP2Q12800 502 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 C7orf61Q8IZ16 206 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 XAGE2Q96GT9 111 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 GDF15Q99988 308 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 C11orf49Q9H6J7 331 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 RAI14Q9P0K7 980 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-210ENST00000442481 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 RHBDL3P58872 404 aa14.27□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 SPATA5Q8NB90 893 aa14.27□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.27□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.27□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.27□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 DDX19BQ9UMR2 479 aa14.27□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.27□□□□□ -0.13
PRAME-210ENST00000442481 ATAD5Q96QE3 1844 aa14.27□□□□□ -0.13
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