RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 AFAP1L1Q8TED9 768 aa12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 HDAC9Q9UKV0 1011 aa12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM14Q14142 442 aa12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 CADPS2Q86UW7 1296 aa12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 MIGA1Q8NAN2 632 aa12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS16Q9H269 839 aa12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 AKAP4Q5JQC9 854 aa12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 RBSNQ9H1K0 784 aa12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 KAT6BQ8WYB5 2073 aa12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1B0GUL7 405 aa12.3□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 PLCD1P51178 756 aa12.3□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 SV2BQ7L1I2 683 aa12.3□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 CARD6Q9BX69 1037 aa12.3□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 TNNQ9UQP3 1299 aa12.3□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF20BQ96Q89 1820 aa12.3□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 NEDD9Q14511 834 aa12.3□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 AKNAD1Q5T1N1 836 aa12.3□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 SNX16P57768 344 aa12.3□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 GMNNO75496 209 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 CPA1P15085 419 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 LETM2Q2VYF4 491 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF365Q70YC5 407 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGEB6Q8N7X4 407 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPYL6Q8N831 410 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNH3Q9ULD8 1083 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 INPP5BP32019 993 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 HSPA1LP34931 641 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 RUFY4Q6ZNE9 571 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 KRBA2Q6ZNG9 492 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF804AQ7Z570 1209 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA6CA6NDK9 693 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 BACH1O14867 736 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 SEC24BO95487 1268 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA6DP0CG33 693 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 PCK1P35558 622 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF174Q15697 407 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 ANO1Q5XXA6 986 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 STX10O60499 249 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 BIRC3Q13489 604 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 PLS1Q14651 629 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP128Q6ZU80 1094 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 MLKLQ8NB16 471 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP6O43182 974 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 TNFAIP3P21580 790 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT9P35527 623 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 FANCCQ00597 558 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 PDE4DQ08499 809 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 CROCCP2Q86T23 111 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 CABS1Q96KC9 395 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 CETN3O15182 167 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 CIB2O75838 187 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 ZWINTO95229 277 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 EPB41P11171 864 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM173BQ6P4H8 233 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 ZRANB1Q9UGI0 708 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 ODF2LQ9ULJ1 636 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP11AP98196 1134 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 TFCP2Q12800 502 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP26C1Q6V0L0 522 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 VSIG1Q86XK7 387 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 ROBO2Q9HCK4 1378 aa12.27□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGEA1P43355 309 aa12.27□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 TPTE2Q6XPS3 522 aa12.27□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 POTEDQ86YR6 584 aa12.27□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 LMNTD2Q8IXW0 634 aa12.27□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 IFT20Q8IY31 132 aa12.27□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 FNBP1Q96RU3 617 aa12.27□□□□□ -0.44
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM204AQ9H8W3 233 aa12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms