RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421019.1

SMIM25-201, Transcript of small integral membrane protein 25, humanhuman

TSL 2

Gene SMIM25, Length 686 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM25-201ENST00000421019 GORABQ5T7V8 394 aa13.48□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF280CQ8ND82 737 aa13.48□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 NEUROD6Q96NK8 337 aa13.48□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 HMG20BQ9P0W2 317 aa13.48□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 MYH13Q9UKX3 1938 aa13.48□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 USP17L5A8MUK1 530 aa13.47□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 CAP2P40123 477 aa13.47□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 TREML2Q5T2D2 321 aa13.47□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 NECAB2Q7Z6G3 386 aa13.47□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 ARHGAP45Q92619 1136 aa13.47□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 RAI14Q9P0K7 980 aa13.47□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 MYH2Q9UKX2 1941 aa13.47□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 HMGCRP04035 888 aa13.46□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 HMGCS2P54868 508 aa13.46□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 SH3D19Q5HYK7 790 aa13.46□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 ANKLE1Q8NAG6 615 aa13.46□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 SPATA5Q8NB90 893 aa13.46□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF384Q8TF68 577 aa13.46□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP13.46□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 AS3MTQ9HBK9 375 aa13.46□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
SMIM25-201ENST00000421019 RPTORQ8N122 1335 aa13.45□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 FAM196BA6NMK8 535 aa13.45□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa13.45□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 RARSP54136 660 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa13.45□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 TEX11Q8IYF3 940 aa13.45□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 LRP2BPQ9P2M1 347 aa13.45□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 PI4KBQ9UBF8 816 aa13.45□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 GJD2Q9UKL4 321 aa13.45□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 PLCG2P16885 1265 aa13.44□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP13.44□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 WDR18Q9BV38 432 aa13.44□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 MORF4L1Q9UBU8 362 aa13.44□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 STAP2Q9UGK3 403 aa13.44□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 DOCK3Q8IZD9 2030 aa13.44□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 DOCK2Q92608 1830 aa13.43□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 MGAMO43451 1857 aa13.43□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 BAG3O95817 575 aa13.43□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 ASNSP08243 561 aa13.43□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 PI16Q6UXB8 463 aa13.43□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 NBPF3Q9H094 633 aa13.43□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 GINM1Q9NU53 330 aa13.43□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 TMOD4Q9NZQ9 345 aa13.43□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 C19orf81C9J6K1 198 aa13.42□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 IGSF3O75054 1194 aa13.42□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 GNAI2P04899 355 aa13.42□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 BMP8BP34820 402 aa13.42□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 BACE1P56817 501 aa13.42□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 SLC17A8Q8NDX2 589 aa13.42□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 DOCK1Q14185 1865 aa13.42□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 MCAMP43121 646 aa13.41□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 PPP4CP60510 307 aa13.41□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 MTMR2Q13614 643 aa13.41□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa13.41□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 GDF15Q99988 308 aa13.41□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 NUDT12Q9BQG2 462 aa13.41□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 PTPRFP10586 1907 aa13.41□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 USP17L10C9JJH3 530 aa13.4□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 CYP2B6P20813 491 aa13.4□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 MAPK4P31152 587 aa13.4□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 CCDC158Q5M9N0 1113 aa13.4□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 GPR153Q6NV75 609 aa13.4□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 C7orf61Q8IZ16 206 aa13.4□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 SOCS4Q8WXH5 440 aa13.4□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 TRIB2Q92519 343 aa13.4□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 TRIM34Q9BYJ4 488 aa13.4□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 C11orf49Q9H6J7 331 aa13.4□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 GPR108Q9NPR9 543 aa13.4□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP13.4□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 OGDHLQ9ULD0 1010 aa13.4□□□□□ -0.26
SMIM25-201ENST00000421019 PHIPQ8WWQ0 1821 aa13.39□□□□□ -0.27
SMIM25-201ENST00000421019 HERVK_113P62684 666 aa13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms