RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412425.1

RAB6C-AS1-201, RAB6C antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB6C-AS1, Length 2,454 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CHAMP1Q96JM3 812 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CENPHQ9H3R5 247 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZWILCHQ9H900 591 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TPCN1Q9ULQ1 816 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GMEB1Q9Y692 573 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TTC41PQ6P2S7 1318 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CCDC192P0DO97 292 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LMNB1P20700 586 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CDC25BP30305 580 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PSMD7P51665 324 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 USP11P51784 963 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CLCN2P51788 898 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PDE4BQ07343 736 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GNPTABQ3T906 1256 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MYO1HQ8N1T3 1032 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 AFAP1L1Q8TED9 768 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ACSBG1Q96GR2 724 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SH3GL1Q99961 368 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TRIM5Q9C035 493 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PCDH18Q9HCL0 1135 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CROTQ9UKG9 612 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MYO5BQ9ULV0 1848 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NAIPQ13075 1403 aa8.26□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZNF521Q96K83 1311 aa8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SMIM24O75264 130 aa8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RABGGTAQ92696 567 aa8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 OSBPL10Q9BXB5 764 aa8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CAPS2Q9BXY5 557 aa8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HELLSQ9NRZ9 838 aa8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 QPCTLQ9NXS2 382 aa8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 USP21Q9UK80 565 aa8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HFM1A2PYH4 1435 aa8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ABCC5O15440 1437 aa8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 A0A1B0GVG6 124 aa8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MCM3P25205 808 aa8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NEK2P51955 445 aa8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PANK1Q8TE04 598 aa8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GBP3Q9H0R5 595 aa8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GALNT8Q9NY28 637 aa8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MYO1AQ9UBC5 1043 aa8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa8.25□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LINGO3P0C6S8 592 aa8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NUGGCQ68CJ6 796 aa8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 USP48Q86UV5 1035 aa8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TMEM87AQ8NBN3 555 aa8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 USP33Q8TEY7 942 aa8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CLIP3Q96DZ5 547 aa8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SLC39A3Q9BRY0 314 aa8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 USP26Q9BXU7 913 aa8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 VCPKMTQ9H867 229 aa8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HOXC10Q9NYD6 342 aa8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MAP3K5Q99683 1374 aa8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 A6NHS1 94 aa8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ABL1P00519 1130 aa8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 BDNFP23560 247 aa8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PHEXP78562 749 aa8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IFFO1Q0D2I5 559 aa8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 BICDL1Q6ZP65 573 aa8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LCA5Q86VQ0 697 aa8.24□□□□□ -1.09
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms