RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 GSTO1P78417 241 aa23.4■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 SLC39A14Q15043 492 aa23.4■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.4■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 TMC4Q7Z404 712 aa23.4■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 JMYQ8N9B5 988 aa23.4■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 FSIP1Q8NA03 581 aa23.4■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa23.4■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 ATP2B4P23634 1241 aa23.39■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 NBPF11Q86T75 865 aa23.39■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.39■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.39■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 SLC26A6Q9BXS9 759 aa23.39■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 CLIC4Q9Y696 253 aa23.39■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 BBOX1O75936 387 aa23.39■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 SERPINB2P05120 415 aa23.39■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23.39■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 MYL10Q9BUA6 226 aa23.39■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 DDAH1O94760 285 aa23.38■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 ADCY5O95622 1261 aa23.38■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.38■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 BRWD3Q6RI45 1802 aa23.38■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 PPP4CP60510 307 aa23.37■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa23.37■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 AIFM3Q96NN9 605 aa23.37■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 LRRC37AA6NMS7 1700 aa23.37■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 USP17L12C9JPN9 530 aa23.37■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 USP17L21D6R901 530 aa23.37■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 MMP1P03956 469 aa23.37■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 CMA1P23946 247 aa23.37■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.37■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.37■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.37■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.337e-7■■■■■ 63.9
SUMO3-204ENST00000411651 ANO6Q4KMQ2 910 aa23.36■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.36■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.36■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa23.35■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 LDHCP07864 332 aa23.35■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 PDE4BQ07343 736 aa23.35■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 STX1AQ16623 288 aa23.35■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.35■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 BAG3O95817 575 aa23.34■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 TPM3P06753 285 aa23.34■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 IL1R1P14778 569 aa23.34■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.34■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 TIGD1Q96MW7 591 aa23.34■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 MAP3K14Q99558 947 aa23.34■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 CBX8Q9HC52 389 aa23.34■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 PTPAQ15257 358 aa23.33■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SUMO3-204ENST00000411651 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 PTMAP06454 111 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 XBP1P17861 261 aa23.33■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF165P49910 485 aa23.33■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 TROAPQ12815 778 aa23.33■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 ANO10Q9NW15 660 aa23.33■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 GGA1Q9UJY5 639 aa23.33■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 LTBP1Q14766 1721 aa23.33■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 GPSM2P81274 684 aa23.32■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.32■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.32■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 FUT2Q10981 343 aa23.31■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.31■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.31■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.31■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 NDUFA8P51970 172 aa23.31■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 TXNRD1Q16881 649 aa23.31■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 CD209Q9NNX6 404 aa23.31■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.3■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 DDR1Q08345 913 aa23.3■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 C12orf60Q5U649 245 aa23.3■■□□□ 1.32
SUMO3-204ENST00000411651 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 136.3 ms