RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375429.7

NELFE-202, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NELFE, Length 1,584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-202ENST00000375429 HLA-DOAP06340 250 aa24.53■■□□□ 1.52
NELFE-202ENST00000375429 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
NELFE-202ENST00000375429 CDC37L1Q7L3B6 337 aa24.53■■□□□ 1.52
NELFE-202ENST00000375429 DYNLL2Q96FJ2 89 aa24.53■■□□□ 1.52
NELFE-202ENST00000375429 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
NELFE-202ENST00000375429 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.53■■□□□ 1.52
NELFE-202ENST00000375429 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
NELFE-202ENST00000375429 INCENPQ9NQS7 918 aa24.53■■□□□ 1.52
NELFE-202ENST00000375429 KIF3CO14782 793 aa24.52■■□□□ 1.52
NELFE-202ENST00000375429 MCCP23508 829 aa24.52■■□□□ 1.52
NELFE-202ENST00000375429 RNF20Q5VTR2 975 aa24.52■■□□□ 1.52
NELFE-202ENST00000375429 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.52■■□□□ 1.52
NELFE-202ENST00000375429 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
NELFE-202ENST00000375429 GABPAQ06546 454 aa24.51■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 EHD4Q9H223 541 aa24.51■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 SERPINB13Q9UIV8 391 aa24.51■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 FAM196BA6NMK8 535 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 TSGA10IPQ3SY00 556 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 STOX1Q6ZVD7 989 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 DNAJC18Q9H819 358 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 E7EWF7 191 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 STAG1Q8WVM7 1258 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 FGRP09769 529 aa24.48■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 CDK8P49336 464 aa24.48■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 CDCA5Q96FF9 252 aa24.48■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 MAP3K10Q02779 954 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 ADCK5Q3MIX3 580 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 CHADLQ6NUI6 762 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 TRAF5O00463 557 aa24.46■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 TBC1D12O60347 775 aa24.46■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 PRDM1O75626 825 aa24.46■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 PDE4BQ07343 736 aa24.46■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.46■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.46■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 SWAP70Q9UH65 585 aa24.46■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 MYH8P13535 1937 aa24.46■■□□□ 1.51
NELFE-202ENST00000375429 NEDD4P46934 1319 aa24.45■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.45■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 SHMT1P34896 483 aa24.45■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 ANAPC15P60006 121 aa24.45■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 TRIM34Q9BYJ4 488 aa24.45■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.45■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 ORC4O43929 436 aa24.44■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 TATDN1Q6P1N9 297 aa24.44■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 HOOK2Q96ED9 719 aa24.44■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 IL17RAQ96F46 866 aa24.44■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 TOMM22Q9NS69 142 aa24.44■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.44■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 FZD1Q9UP38 647 aa24.44■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 KRT32Q14532 448 aa24.43■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 KIF2CQ99661 725 aa24.43■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 B4E1Z4 1266 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 RASA1P20936 1047 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 DCAF15Q66K64 600 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 NCOA7Q8NI08 942 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 NEK1Q96PY6 1258 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 TRDNQ13061 729 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 KRT23Q9C075 422 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 PHF20L1A8MW92 1017 aa24.41■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 PRKG1Q13976 671 aa24.41■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.41■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.41■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 NF2P35240 595 aa24.4■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.4■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 KDM4AO75164 1064 aa24.39■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 TOMM70O94826 608 aa24.39■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 CPA1P15085 419 aa24.39■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms