RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316786.1

C9orf106-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 106 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf106, Length 3,145 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106-201ENST00000316786 APOA5Q6Q788 366 aa15.4■□□□□ 0.06
C9orf106-201ENST00000316786 STAG1Q8WVM7 1258 aa15.4■□□□□ 0.06
C9orf106-201ENST00000316786 LY9Q9HBG7 655 aa15.4■□□□□ 0.06
C9orf106-201ENST00000316786 USP17L12C9JPN9 530 aa15.39■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 USP17L21D6R901 530 aa15.39■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP15.39■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 TTC6Q86TZ1 520 aa15.39■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 TBC1D16Q8TBP0 767 aa15.39■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 CD209Q9NNX6 404 aa15.39■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 WDR19Q8NEZ3 1342 aa15.39■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 RIMBP2O15034 1052 aa15.39■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 LDHBP07195 334 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 CDC27P30260 824 aa15.39■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 PDCL2Q8N4E4 241 aa15.39■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 TMEM87AQ8NBN3 555 aa15.39■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa15.39■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP15.39■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 KRT85P78386 507 aa15.39■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 BRIP1Q9BX63 1249 aa15.39■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 SRGNP10124 158 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 CTR9Q6PD62 1173 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 PHKBQ93100 1093 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 TMEM87BQ96K49 555 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 CRAMP1Q96RY5 1269 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 KRT23Q9C075 422 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 CNNM2Q9H8M5 875 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 UBE2Q2LH0YL09 131 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 RESTQ13127 1097 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 AIFM3Q96NN9 605 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP15.38■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 IRF6O14896 467 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 CYP2D6P10635 497 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 ATP2B4P23634 1241 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF710Q8N1W2 664 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 WDR66Q8TBY9 1149 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 PARP3Q9Y6F1 533 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 CLSTN1O94985 981 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 MYH2Q9UKX2 1941 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 ZBTB43O43298 467 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 UBE2HP62256 183 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 SEMA3FQ13275 785 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 SLC12A7Q9Y666 1083 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 TIAM2Q8IVF5 1701 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 CCDC69A6NI79 296 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 SGMS1Q86VZ5 419 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 CCDC82Q8N4S0 544 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 GOLGA8AA7E2F4 631 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF445P59923 1031 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 USP17L8P0C7I0 530 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 WTAPQ15007 396 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 MFSD14BQ5SR56 506 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 SPATA32Q96LK8 384 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 TSPYL1Q9H0U9 437 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 LIFRP42702 1097 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 FLAD1Q8NFF5 587 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 C8orf76Q96K31 380 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 UBAC1Q9BSL1 405 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 MCM9Q9NXL9 1143 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 RSPH14Q9UHP6 348 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 ANAPC4Q9UJX5 808 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 SP8Q8IXZ3 490 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 NUP133Q8WUM0 1156 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 FBXW7Q969H0 707 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 PPP1R9BQ96SB3 815 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 TNKSO95271 1327 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 IL1R1P14778 569 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 SART3Q15020 963 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 ESR2Q92731 530 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 ERICH2A1L162 156 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 NMT2O60551 498 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 NPR1P16066 1061 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf106-201ENST00000316786 GTF2IP78347 998 aa15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms