RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cyp2c39P56656 490 aa26.25■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cntnap5bQ0V8T8 1292 aa26.25■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cdcp1Q5U462 833 aa26.25■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Myh6Q02566 1938 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Has3O08650 554 aa26.24■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Csrnp3P59055 597 aa26.24■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ift57Q8BXG3 429 aa26.24■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Myo15bI7HPW8 3033 aa26.24■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Myh14Q6URW6 2000 aa26.24■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lamp1P11438 406 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kcnh8P59111 1102 aa26.23■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pof1bQ8K4L4 587 aa26.23■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam205a1D3YZF6 1314 aa26.22■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mms22lB1AUR6 1238 aa26.22■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 B020004C17RikJ3QP07 232 aa26.22■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 DcxO88809 366 aa26.22■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ero1aQ8R180 464 aa26.22■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Smc1bQ920F6 1248 aa26.22■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gon4lQ9DB00 2260 aa26.21■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Timm10P62073 90 aa26.21■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Calr4Q3TQS0 420 aa26.21■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sv2cQ69ZS6 727 aa26.21■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nim1kQ8BHI9 436 aa26.21■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PaoxQ8C0L6 504 aa26.21■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zbed3Q9D0L1 228 aa26.21■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ngly1Q9JI78 651 aa26.21■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Disp2Q8CIP5 1345 aa26.2■■□□□ 1.79
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tuft1O08970 390 aa26.2■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 GclcP97494 637 aa26.2■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Klhdc9Q3USL1 350 aa26.2■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc84Q4VA36 332 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc9c1Q6UJY2 1175 aa26.2■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 NesQ6P5H2 1864 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 TsksO54887 585 aa26.19■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Asap2Q7SIG6 958 aa26.19■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 FanclQ9CR14 375 aa26.19■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Myh3P13541 1940 aa26.19■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa26.18■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Palm3A2TJV2 734 aa26.18■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dcaf15Q6PFH3 600 aa26.18■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 4930504O13RikQ8C5Z9 145 aa26.18■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atg4aQ8C9S8 396 aa26.18■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PfkpQ9WUA3 784 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 RptorQ8K4Q0 1335 aa26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pramef17A2ASJ1 475 aa26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 DaxxO35613 739 aa26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam83hQ148V8 1209 aa26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Samd11Q1RNF8 542 aa26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 SkilQ60665 675 aa26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fndc3bQ6NWW9 1207 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Aldh8a1Q8BH00 487 aa26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmem266Q8BZB3 538 aa26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm9857F7CXR1 130 aa26.16■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hoxa7P02830 229 aa26.16■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Stat5bP42232 786 aa26.16■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atp9bP98195 1146 aa26.16■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfp90Q61967 636 aa26.16■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Armcx1Q9CX83 456 aa26.16■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa26.15■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 LifrP42703 1092 aa26.15■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 DbnlQ62418 436 aa26.15■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ube3cQ80U95 1083 aa26.15■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trim32Q8CH72 655 aa26.15■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trib2Q8K4K3 343 aa26.15■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc26a8Q8R0C3 999 aa26.15■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Epb41l3Q9WV92 929 aa26.15■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pnmal2G3X9N3 661 aa26.14■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Morf4l1P60762 362 aa26.14■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dync1li2Q6PDL0 492 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atl3Q91YH5 541 aa26.14■■□□□ 1.78
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Frmpd4A2AFR3 1320 aa26.14■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc6a20bO88575 635 aa26.13■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Abtb2Q7TQI7 1024 aa26.13■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc4a1P04919 929 aa26.12■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cgnl1Q6AW69 1298 aa26.12■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cyp26b1Q811W2 512 aa26.12■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Riok1Q922Q2 567 aa26.12■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gcc1Q9D4H2 778 aa26.12■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Jbts17Q8CE72 3214 aa26.12■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hcn4O70507 1186 aa26.11■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rnf157Q3TEL6 685 aa26.11■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Defa-rs10Q64263 91 aa26.11■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Calhm4Q8CE93 315 aa26.11■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 LtkP08923 888 aa26.1■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kiaa1211Q5PR69 1207 aa26.1■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tbc1d10bQ8BHL3 798 aa26.1■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MylipQ8BM54 445 aa26.1■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dlk2Q8K1E3 382 aa26.1■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Col20a1Q923P0 1320 aa26.1■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 D630036H23RikQ3UQD6 204 aa26.09■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Btg1-ps1Q3V0S2 161 aa26.09■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Btg1-ps2Q3V0X0 161 aa26.09■■□□□ 1.77
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Esyt3Q5DTI8 891 aa26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 58.8 ms