RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000115302.1

Cldn16-201, Transcript of Claudin-16, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cldn16, Length 950 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Ddx27Q921N6 760 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Ndufb5Q9CQH3 189 aa9.51□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa9.51□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Fam213aQ9CYH2 218 aa9.51□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Foxo4Q9WVH3 505 aa9.51□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Cct4P80315 539 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gja5Q01231 358 aa9.5□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Soga3Q6NZL0 945 aa9.5□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Ripor2Q80U16 1078 aa9.5□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa9.5□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa9.5□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Zfp831A2ADM8 1628 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Col5a2Q3U962 1497 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gm13119B1ARV5 481 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Cyp2c69E9PXC3 491 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Cops6O88545 324 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Atp6v0a2P15920 856 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 MafbP54841 323 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Clca2Q8BG22 942 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gulp1Q8K2A1 304 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Sh2b1Q91ZM2 756 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Nup188Q6ZQH8 1759 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Hoxd9P28357 339 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Dusp23Q6NT99 150 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Atxn2lQ7TQH0 1049 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Adamts2Q8C9W3 1213 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 FktnQ8R507 461 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 NmiO35309 314 aa9.47□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Zap70P43404 618 aa9.47□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Eva1cP58659 440 aa9.47□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 EgfrQ01279 1210 aa9.47□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 TrhQ62361 256 aa9.47□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Dlk2Q8K1E3 382 aa9.47□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 GptQ8QZR5 496 aa9.47□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Pcgf6Q99NA9 353 aa9.47□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Myo3bQ1EG27 1305 aa9.47□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa9.46□□□□□ -0.89
Cldn16-201ENSMUST00000115302 A0A1Y7VLE6 161 aa9.46□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 D830030K20RikE9PYQ5 218 aa9.46□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gm3043K7N693 218 aa9.46□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gm16440K7N6G6 218 aa9.46□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gm2244L7N2A3 218 aa9.46□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gm3278L7N2D2 218 aa9.46□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gm8271L7N2E2 218 aa9.46□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Grm8P47743 908 aa9.46□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Smc4Q8CG47 1286 aa9.46□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Osbpl3Q9DBS9 855 aa9.46□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa9.46□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Megf6Q80V70 1572 aa9.46□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Olfr247E9PVJ7 320 aa9.45□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Trim34bJ3QNR8 485 aa9.45□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Olfr819K7N727 320 aa9.45□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Ppef1O35655 650 aa9.45□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 CanxP35564 591 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Vipr2P41588 437 aa9.45□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Wnt11P48615 354 aa9.45□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 St8sia5P70126 412 aa9.45□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Psd3Q2PFD7 1037 aa9.45□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gpr162Q3UN16 588 aa9.45□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gnat3Q3V3I2 354 aa9.45□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Mum1Q6DID5 682 aa9.45□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Ttc19Q8CC21 365 aa9.45□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Col26a1Q91VF6 440 aa9.45□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Edem1Q925U4 652 aa9.45□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Ttc5Q99LG4 440 aa9.45□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Rwdd1Q9CQK7 243 aa9.45□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gm7347D3YYI9 267 aa9.44□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Speer4aF8VPX6 267 aa9.44□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Wisp1O54775 367 aa9.44□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 L3mbtl2P59178 703 aa9.44□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Unc5clQ6R653 518 aa9.44□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 NexnQ7TPW1 607 aa9.44□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Cd248Q91V98 765 aa9.44□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gja10Q9WUS4 505 aa9.44□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Phrf1A6H619 1682 aa9.43□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Heg1E9Q7X6 1337 aa9.43□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Krtap28-13A0A087WQP5 138 aa9.43□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gm38119A0A0A6YX29 146 aa9.43□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Klrk1O54709 232 aa9.43□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Dpf2Q61103 391 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Pcsk7Q61139 770 aa9.43□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Zcwpw1Q6IR42 630 aa9.43□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Pla2g1bQ9Z0Y2 146 aa9.43□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Cyp2ab1S4R196 498 aa9.43□□□□□ -0.9
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Btaf1E9QAE3 1848 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9.1 ms