Protein–RNA interactions for Protein: P48615

Wnt11, Protein Wnt-11, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wnt11P48615 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,07■■■■□ 3,04
Wnt11P48615 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Wnt11P48615 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Wnt11P48615 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Wnt11P48615 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Wnt11P48615 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Wnt11P48615 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,15■■■□□ 2,42
Wnt11P48615 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
Wnt11P48615 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Wnt11P48615 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,41■■■□□ 2,3
Wnt11P48615 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,37■■■□□ 2,29
Wnt11P48615 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Wnt11P48615 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,89■■■□□ 2,22
Wnt11P48615 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Wnt11P48615 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Wnt11P48615 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Wnt11P48615 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
Wnt11P48615 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Wnt11P48615 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Wnt11P48615 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Wnt11P48615 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Wnt11P48615 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Wnt11P48615 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Wnt11P48615 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Wnt11P48615 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Wnt11P48615 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Wnt11P48615 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Wnt11P48615 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Wnt11P48615 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
Wnt11P48615 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Wnt11P48615 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Wnt11P48615 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Wnt11P48615 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Wnt11P48615 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Wnt11P48615 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Wnt11P48615 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Wnt11P48615 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,66■■■□□ 2,02
Wnt11P48615 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Wnt11P48615 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Wnt11P48615 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Wnt11P48615 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Wnt11P48615 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Wnt11P48615 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Wnt11P48615 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Wnt11P48615 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Wnt11P48615 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Wnt11P48615 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Wnt11P48615 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,89■■□□□ 1,9
Wnt11P48615 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Wnt11P48615 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Wnt11P48615 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Wnt11P48615 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Wnt11P48615 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Wnt11P48615 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Wnt11P48615 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,79■■□□□ 1,88
Wnt11P48615 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Wnt11P48615 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Wnt11P48615 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Wnt11P48615 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Wnt11P48615 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Wnt11P48615 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Wnt11P48615 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Wnt11P48615 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Wnt11P48615 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,48■■□□□ 1,83
Wnt11P48615 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,45■■□□□ 1,82
Wnt11P48615 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Wnt11P48615 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Wnt11P48615 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,4■■□□□ 1,82
Wnt11P48615 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Wnt11P48615 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Wnt11P48615 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Wnt11P48615 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Wnt11P48615 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Wnt11P48615 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Wnt11P48615 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Wnt11P48615 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Wnt11P48615 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Wnt11P48615 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Wnt11P48615 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Wnt11P48615 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Wnt11P48615 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Wnt11P48615 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Wnt11P48615 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Wnt11P48615 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Wnt11P48615 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Wnt11P48615 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Wnt11P48615 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Wnt11P48615 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Wnt11P48615 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Wnt11P48615 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Wnt11P48615 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Wnt11P48615 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Wnt11P48615 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Wnt11P48615 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Wnt11P48615 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Wnt11P48615 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Wnt11P48615 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
Wnt11P48615 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Wnt11P48615 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Wnt11P48615 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,7 ms