RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ang6Q5GAN0 147 aa11.18□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Klk7Q91VE3 249 aa11.18□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv12-3A0A075B5T1 117 aa11.18□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trav16d-dv11A0A075B617 117 aa11.18□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P06330 118 aa11.18□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr1367Q8VFG2 316 aa11.18□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Snai3Q9QY31 287 aa11.18□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P0C913 63 aa11.17□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tex26Q0VB26 296 aa11.17□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lrcol1Q3URS3 161 aa11.17□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MycbQ6P8Z1 170 aa11.17□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10553J3QPF1 123 aa11.17□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr317Q5NCD6 327 aa11.17□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A0A1Y7VMQ4 148 aa11.17□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem262D3Z338 116 aa11.17□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A930009A15RikG3UYI6 118 aa11.17□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr498Q8VEW2 330 aa11.17□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam216aQ9DB54 251 aa11.17□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prrc2aQ7TSC1 2158 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 ColqO35348 457 aa11.16□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mien1Q9CQ86 115 aa11.16□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vsig4F6TUL9 280 aa11.16□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem136Q3TYE7 245 aa11.16□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ndufb4Q9CQC7 129 aa11.16□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rpl11Q9CXW4 178 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A0A286YCQ8 80 aa11.15□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tax1bp3Q9DBG9 124 aa11.15□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dusp14Q9JLY7 198 aa11.15□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv3-8A0A075B5T0 131 aa11.15□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PlnP61014 52 aa11.15□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rbfox3Q8BIF2 374 aa11.15□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 OtorQ9JIE3 128 aa11.15□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv1-66A0A075B5X5 117 aa11.15□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ins1P01325 108 aa11.15□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P01747 120 aa11.15□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm12888Q3UW77 119 aa11.15□□□□□ -0.62
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Usp9xP70398 2559 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm26661M0QWV4 156 aa11.14□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zcwpw2Q08EN7 125 aa11.14□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Isg15Q64339 161 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tspo2Q9CRZ8 162 aa11.14□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv2-3A0A075B696 115 aa11.14□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AY761185Q5ERI8 94 aa11.14□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 4930564D02RikQ9D4S4 103 aa11.14□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rnf114Q9ET26 229 aa11.14□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mrpl36Q99N90 102 aa11.14□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm12845A0A0N4SUM5 588 aa11.13□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P06328 117 aa11.13□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Q24JP4 165 aa11.13□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm5464Q3UY29 175 aa11.13□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AI854703Q8BIN3 203 aa11.13□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Spink10Q8CAC8 162 aa11.13□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ankrd11E9Q4F7 2643 aa11.13□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Runx1Q03347 451 aa11.13□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Psmb8P28063 276 aa11.12□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Timm8bP62077 83 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MdfiP70331 251 aa11.12□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gkn1Q9CR36 201 aa11.12□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Spcs1Q9D958 161 aa11.12□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Q3UNZ8 350 aa11.12□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Il22ra1Q80XZ4 581 aa11.12□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tppp3Q9CRB6 176 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dkk2Q9QYZ8 259 aa11.12□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm11027G8JL69 66 aa11.12□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P01727 129 aa11.12□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defb2P82020 71 aa11.12□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ndufa4Q62425 82 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 BsnO88737 3942 aa11.12□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Arid1bE9Q4N7 2244 aa11.11□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv2-7A0A075B5Q8 116 aa11.11□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv8-8A0A0A6YXQ0 119 aa11.11□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv4-74A0A0B4J1I3 119 aa11.11□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trbv14A0A140T8L9 115 aa11.11□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P06334 169 aa11.11□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hoxd3P09027 433 aa11.11□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem238lA0A1B0GS74 79 aa11.11□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm8439G3UWA7 96 aa11.11□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tcl1b4P56844 120 aa11.11□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gng4P50153 75 aa11.1□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Smim15Q3UTD9 74 aa11.1□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm16223Q8CBM3 117 aa11.1□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm5089A1L3C8 106 aa11.1□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CrxO54751 299 aa11.1□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fhl2O70433 279 aa11.1□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trdv2-1A0A0G2JGB9 116 aa11.09□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm28305F6U473 122 aa11.09□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 S100a4P07091 101 aa11.09□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rpl32P62911 135 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Muc4Q8JZM8 3443 aa11.09□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv5-9-1A0A0A6YVS4 126 aa11.09□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Snrpd3P62320 126 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Khdc1cQ4KL78 166 aa11.09□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr313Q5NC55 308 aa11.09□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdpf1Q8R3A2 119 aa11.09□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hspb8Q9JK92 196 aa11.09□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc35d2Q762D5 326 aa11.09□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ndufc2Q9CQ54 120 aa11.09□□□□□ -0.63
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trbv16A0A0B4J1H3 115 aa11.08□□□□□ -0.64
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Esp3J3QN49 87 aa11.08□□□□□ -0.64
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sumo2P61957 95 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 70.1 ms