RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Acrv1P50289 261 aa7□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Khdc1aQ3UWR2 166 aa7□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm11733Q8BQP1 125 aa7□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 EpcamQ99JW5 315 aa7□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ormdl3Q9CPZ6 153 aa7□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Leprotl1Q9CQ74 131 aa7□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hcfc2Q9D968 241 aa7□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dynlrb2Q9DAJ5 96 aa7□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm26938S4R185 226 aa7□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TnxbO35452 4006 aa7□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 BC067074F6RXI4 2391 aa7□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ighv1-12A0A0A6YXJ9 117 aa6.99□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Igkv20-101-2A0A0G2JDU3 113 aa6.99□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P01739 132 aa6.99□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P01750 117 aa6.99□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 H2-DMb1P35737 261 aa6.99□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnf183Q8QZS5 190 aa6.99□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ifitm2Q99J93 144 aa6.99□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SmagpQ99KC7 97 aa6.99□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pgpep1Q9ESW8 209 aa6.99□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nudt3Q9JI46 168 aa6.99□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ighv1-50A0A075B5W1 117 aa6.98□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ighv1-75A0A075B5Y2 117 aa6.98□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ighv3-3A0A0A6YWL2 116 aa6.98□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm5218F6YH22 154 aa6.98□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tex54G3UW99 86 aa6.98□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 2310050C09RikG5E8Z3 280 aa6.98□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm6176J3QK59 301 aa6.98□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fhl1P97447 280 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm4567Q3UTA8 301 aa6.98□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tnfsf18Q7TS55 173 aa6.98□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnf152Q8BG47 203 aa6.98□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 IqcjQ8BPW0 110 aa6.98□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1367Q8VFG2 316 aa6.98□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1339Q8VGB1 315 aa6.98□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 3110018I06RikQ9CXS0 120 aa6.98□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem88Q9D0N8 159 aa6.98□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lamtor2Q9JHS3 125 aa6.98□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm8439G3UWA7 96 aa6.97□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ighv1-62-3P01754 117 aa6.97□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Srp14P16254 110 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SeboxP70368 190 aa6.97□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdx4Q07424 282 aa6.97□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 H2-DMb2Q31099 261 aa6.97□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cphx2Q8BX39 182 aa6.97□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm9944Q8C559 102 aa6.97□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam216aQ9DB54 251 aa6.97□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm14214V9GX35 225 aa6.97□□□□□ -1.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ighv1-63A0A075B5X2 117 aa6.96□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 2210017I01RikA0A0A6YVV1 95 aa6.96□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm28038F7BCN9 126 aa6.96□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gphb5Q812B2 130 aa6.96□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rbfox3Q8BIF2 374 aa6.96□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gpr82Q8BZR0 328 aa6.96□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ucn2Q99ML8 113 aa6.96□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mrpl53Q9D1H8 118 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ighv12-3A0A075B5T1 117 aa6.95□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 4930447F04RikA2AFR2 126 aa6.95□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rtl10D3YWW5 146 aa6.95□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm20604F8WIA3 75 aa6.95□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 A930009A15RikG3UYI6 118 aa6.95□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnase1P00683 149 aa6.95□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mbd3l2Q3UXB0 228 aa6.95□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 9130213A22RikQ3V3T2 120 aa6.95□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ang5Q5GAN1 145 aa6.95□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm5105Q8C6Y9 112 aa6.95□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1262Q8VGN2 304 aa6.95□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc25a2Q99ML6 265 aa6.95□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Obox1Q9D350 204 aa6.95□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 4930564D02RikQ9D4S4 103 aa6.95□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ighv2-6A0A075B6A7 116 aa6.94□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 A0A1Y7VLE6 161 aa6.94□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Esp38A8R0X1 80 aa6.94□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn1r1E9PVR6 306 aa6.94□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fhl2O70433 279 aa6.94□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sap30O88574 220 aa6.94□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smrp1Q2MH31 260 aa6.94□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Defb26Q30KN7 186 aa6.94□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Il19Q8CJ70 176 aa6.94□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 RnasekQ8K3C0 98 aa6.94□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1012Q8VFJ7 311 aa6.94□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem14cQ9CQN6 114 aa6.94□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Malsu1Q9CWV0 228 aa6.94□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rabac1Q9Z0S9 185 aa6.94□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm10130F6ZHM5 101 aa6.93□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tcf21O35437 179 aa6.93□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P01756 117 aa6.93□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P01757 117 aa6.93□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rbx1P62878 108 aa6.93□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm7489Q3UT34 171 aa6.93□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam222aQ6PGH4 453 aa6.93□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr312Q7TRZ9 308 aa6.93□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1195Q8VG21 308 aa6.93□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trav12-3A0A075B648 115 aa6.92□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Krtap28-13A0A087WQP5 138 aa6.92□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trbv30A0A0B4J1P1 111 aa6.92□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trav14n-2A0A0G2JDF5 121 aa6.92□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm10553J3QPF1 123 aa6.92□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm5150Q1AN92 299 aa6.92□□□□□ -1.3
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr311Q5NC59 308 aa6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44 ms