RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Odf3Q920N1 254 aa12.95□□□□□ -0.34
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ighv1-9A0A0A6YW37 117 aa12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 H2al2bA9Z055 111 aa12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TgfaP48030 159 aa12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gkn1Q9CR36 201 aa12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Obox1Q9D350 204 aa12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ighv1-80A0A075B5Y3 117 aa12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ighv1-82A0A0G2JEU7 117 aa12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Esp3J3QN49 87 aa12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bak1O08734 209 aa12.94□□□□□ -0.34
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TctaQ8VEA7 122 aa12.94□□□□□ -0.34
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arl3Q9WUL7 182 aa12.94□□□□□ -0.34
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Col6a4A2AX52 2309 aa12.87□□□□□ -0.35
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cox11Q6P8I6 275 aa12.87□□□□□ -0.35
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp6v0bQ91V37 205 aa12.86□□□□□ -0.35
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ighv3-3A0A0A6YWL2 116 aa12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Iglc1A0A0G2JE99 106 aa12.84□□□□□ -0.35
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ormdl2Q9CQZ0 153 aa12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SonQ9QX47 2444 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Igkv4-74A0A0B4J1I3 119 aa12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm5629P06327 117 aa12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BlcapP62951 87 aa12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MdfiP70331 251 aa12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Samd10Q7TST3 202 aa12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Muc4Q8JZM8 3443 aa12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trbv13-1A0A0B4J1P8 112 aa12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PspnO70300 156 aa12.83□□□□□ -0.36
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