RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.94	□□□□□ -1.46
JMJD1C-211	ENST00000633035	PSPHP1	O15172	72 aa		5.92	□□□□□ -1.46
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q1T7F1	81 aa		5.89	□□□□□ -1.47
JMJD1C-211	ENST00000633035	MT1L	Q93083	61 aa		5.89	□□□□□ -1.47
JMJD1C-211	ENST00000633035	MT1M	Q8N339	61 aa		5.85	□□□□□ -1.47
JMJD1C-211	ENST00000633035	PCP4	P48539	62 aa		5.84	□□□□□ -1.47
JMJD1C-211	ENST00000633035	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.81	□□□□□ -1.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.8	□□□□□ -1.48
JMJD1C-211	ENST00000633035		A6NED7	52 aa		5.75	□□□□□ -1.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.74	□□□□□ -1.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.7	□□□□□ -1.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.65	□□□□□ -1.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.6	□□□□□ -1.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.6	□□□□□ -1.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	MT4	P47944	62 aa		5.59	□□□□□ -1.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.59	□□□□□ -1.51
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.58	□□□□□ -1.52
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.51	□□□□□ -1.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.5	□□□□□ -1.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	ROMO1	P60602	79 aa		5.48	□□□□□ -1.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.45	□□□□□ -1.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.34	□□□□□ -1.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.28	□□□□□ -1.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.27	□□□□□ -1.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		5.23	□□□□□ -1.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.21	□□□□□ -1.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.21	□□□□□ -1.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		5.19	□□□□□ -1.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.13	□□□□□ -1.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.11	□□□□□ -1.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.11	□□□□□ -1.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.07	□□□□□ -1.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	MT1A	P04731	61 aa		5.03	□□□□□ -1.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.01	□□□□□ -1.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.99	□□□□□ -1.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.97	□□□□□ -1.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.82	□□□□□ -1.64
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.76	□□□□□ -1.65
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.75	□□□□□ -1.65
JMJD1C-211	ENST00000633035	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.73	□□□□□ -1.65
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.64	□□□□□ -1.67
JMJD1C-211	ENST00000633035	MT3	P25713	68 aa		4.63	□□□□□ -1.67
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.62	□□□□□ -1.67
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.48	□□□□□ -1.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.44	□□□□□ -1.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.34	□□□□□ -1.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.31	□□□□□ -1.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.2	□□□□□ -1.74
JMJD1C-211	ENST00000633035		H3BS24	57 aa		4.14	□□□□□ -1.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.11	□□□□□ -1.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.08	□□□□□ -1.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4	□□□□□ -1.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.9	□□□□□ -1.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.89	□□□□□ -1.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.89	□□□□□ -1.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.68	□□□□□ -1.82
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.51	□□□□□ -1.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.42	□□□□□ -1.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.26	□□□□□ -1.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.22	□□□□□ -1.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.03	□□□□□ -1.92
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.01	□□□□□ -1.93
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRM1	P04553	51 aa		2.8	□□□□□ -1.96
JMJD1C-211	ENST00000633035	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.71	□□□□□ -1.98
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A0A0MQY5	61 aa		2.71	□□□□□ -1.98
JMJD1C-211	ENST00000633035	INE1	O15225	51 aa		2.71	□□□□□ -1.98
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.3	□□□□□ -2.04
JMJD1C-211	ENST00000633035	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.91	□□□□□ -2.1

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