RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609041.1

TAF4-208, Transcript of TATA-box binding protein associated factor 4, human

Gene TAF4, Length 2,487 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TAF4-208	ENST00000609041	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
TAF4-208	ENST00000609041	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		6.42	□□□□□ -1.38
TAF4-208	ENST00000609041	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		6.39	□□□□□ -1.39
TAF4-208	ENST00000609041	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		6.37	□□□□□ -1.39
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		6.35	□□□□□ -1.39
TAF4-208	ENST00000609041	MT1M	Q8N339	61 aa		6.33	□□□□□ -1.4
TAF4-208	ENST00000609041	MT1G	P13640	62 aa		6.32	□□□□□ -1.4
TAF4-208	ENST00000609041	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		6.18	□□□□□ -1.42
TAF4-208	ENST00000609041	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		6.17	□□□□□ -1.42
TAF4-208	ENST00000609041	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		6.15	□□□□□ -1.43
TAF4-208	ENST00000609041	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.44
TAF4-208	ENST00000609041	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
TAF4-208	ENST00000609041	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
TAF4-208	ENST00000609041	MDN1	Q9NU22	5596 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TAF4-208	ENST00000609041	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TAF4-208	ENST00000609041	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP5-9	P26371	169 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TAF4-208	ENST00000609041	MT1A	P04731	61 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TAF4-208	ENST00000609041	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
TAF4-208	ENST00000609041	SPRR2E	P22531	72 aa		5.62	□□□□□ -1.51
TAF4-208	ENST00000609041	SPRR2B	P35325	72 aa		5.62	□□□□□ -1.51
TAF4-208	ENST00000609041	SPRR2A	P35326	72 aa		5.62	□□□□□ -1.51
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
TAF4-208	ENST00000609041	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TAF4-208	ENST00000609041	SPRR2D	P22532	72 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TAF4-208	ENST00000609041	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.34	□□□□□ -1.55
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TAF4-208	ENST00000609041	PRM1	P04553	51 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TAF4-208	ENST00000609041	MT3	P25713	68 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TAF4-208	ENST00000609041	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TAF4-208	ENST00000609041	NEB	P20929	6669 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TAF4-208	ENST00000609041	MT4	P47944	62 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TAF4-208	ENST00000609041	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF4-208	ENST00000609041	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TAF4-208	ENST00000609041	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.45	□□□□□ -1.7
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TAF4-208	ENST00000609041	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.29	□□□□□ -1.72
TAF4-208	ENST00000609041	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TAF4-208	ENST00000609041	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4	□□□□□ -1.77
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TAF4-208	ENST00000609041	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.71	□□□□□ -1.81
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.7	□□□□□ -1.82
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TAF4-208	ENST00000609041	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TAF4-208	ENST00000609041	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TAF4-208	ENST00000609041	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.24	□□□□□ -1.89
TAF4-208	ENST00000609041	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.24	□□□□□ -1.89
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TAF4-208	ENST00000609041	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TAF4-208	ENST00000609041	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TAF4-208	ENST00000609041	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TAF4-208	ENST00000609041	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
TAF4-208	ENST00000609041	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.97	□□□□□ -2.09

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