RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

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Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MT1MQ8N339 61 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MT1GP13640 62 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.04□□□□□ -1.28
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MDN1Q9NU22 5596 aa6.82□□□□□ -1.32
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.78□□□□□ -1.32
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.65□□□□□ -1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP5-9P26371 169 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP12-4P60329 112 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPRR2EP22531 72 aa6.54□□□□□ -1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPRR2BP35325 72 aa6.54□□□□□ -1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPRR2AP35326 72 aa6.54□□□□□ -1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LCE3BQ5TA77 95 aa6.54□□□□□ -1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.47□□□□□ -1.37
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.38□□□□□ -1.39
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MT1AP04731 61 aa6.37□□□□□ -1.39
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPRR2DP22532 72 aa6.26□□□□□ -1.41
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.18□□□□□ -1.42
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.16□□□□□ -1.42
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.04□□□□□ -1.44
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.03□□□□□ -1.44
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.93□□□□□ -1.46
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRM1P04553 51 aa5.9□□□□□ -1.46
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.86□□□□□ -1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NEBP20929 6669 aa5.8□□□□□ -1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MT3P25713 68 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.67□□□□□ -1.5
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.57□□□□□ -1.52
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MT4P47944 62 aa5.56□□□□□ -1.52
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.39□□□□□ -1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.37□□□□□ -1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LCE4AQ5TA78 99 aa5.37□□□□□ -1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.31□□□□□ -1.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.25□□□□□ -1.57
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LCE1DQ5T752 114 aa5.24□□□□□ -1.57
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.23□□□□□ -1.57
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.1□□□□□ -1.59
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MUC5ACP98088 5654 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LCE1EQ5T753 118 aa4.71□□□□□ -1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.55□□□□□ -1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.54□□□□□ -1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.52□□□□□ -1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.52□□□□□ -1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.5□□□□□ -1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LCE1CQ5T751 118 aa4.46□□□□□ -1.7
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.37□□□□□ -1.71
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.35□□□□□ -1.71
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP5-8O75690 187 aa4.3□□□□□ -1.72
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.16□□□□□ -1.74
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LCE1FQ5T754 118 aa4.15□□□□□ -1.74
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.14□□□□□ -1.75
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.89□□□□□ -1.79
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.85□□□□□ -1.79
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.71□□□□□ -1.82
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PHGR1C9JFL3 82 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.18□□□□□ -2.06
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