RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 INE1O15225 51 aa4.01□□□□□ -1.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.98□□□□□ -1.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.92□□□□□ -1.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.91□□□□□ -1.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.91□□□□□ -1.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.91□□□□□ -1.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MT1GP13640 62 aa3.88□□□□□ -1.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.87□□□□□ -1.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MT1MQ8N339 61 aa3.86□□□□□ -1.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.84□□□□□ -1.79
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.83□□□□□ -1.8
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MDN1Q9NU22 5596 aa3.77□□□□□ -1.81
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.75□□□□□ -1.81
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.67□□□□□ -1.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.66□□□□□ -1.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCE3BQ5TA77 95 aa3.57□□□□□ -1.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.57□□□□□ -1.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.56□□□□□ -1.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP5-9P26371 169 aa3.52□□□□□ -1.85
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.52□□□□□ -1.85
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.52□□□□□ -1.85
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP12-4P60329 112 aa3.5□□□□□ -1.85
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPRR2EP22531 72 aa3.49□□□□□ -1.85
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPRR2BP35325 72 aa3.49□□□□□ -1.85
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPRR2AP35326 72 aa3.49□□□□□ -1.85
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MT1AP04731 61 aa3.42□□□□□ -1.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.4□□□□□ -1.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPRR2DP22532 72 aa3.33□□□□□ -1.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.29□□□□□ -1.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.25□□□□□ -1.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.24□□□□□ -1.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.23□□□□□ -1.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.21□□□□□ -1.9
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.2□□□□□ -1.9
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.17□□□□□ -1.9
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.16□□□□□ -1.9
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCE1DQ5T752 114 aa3.14□□□□□ -1.91
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NEBP20929 6669 aa3.1□□□□□ -1.91
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MT3P25713 68 aa3.08□□□□□ -1.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRM1P04553 51 aa3.08□□□□□ -1.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.07□□□□□ -1.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCE1EQ5T753 118 aa3.03□□□□□ -1.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.02□□□□□ -1.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MT4P47944 62 aa2.99□□□□□ -1.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.97□□□□□ -1.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.91□□□□□ -1.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.87□□□□□ -1.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.85□□□□□ -1.95
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCE4AQ5TA78 99 aa2.82□□□□□ -1.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.8□□□□□ -1.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCE1FQ5T754 118 aa2.78□□□□□ -1.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.69□□□□□ -1.98
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MUC5ACP98088 5654 aa2.67□□□□□ -1.98
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.58□□□□□ -2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.55□□□□□ -2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.43□□□□□ -2.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.41□□□□□ -2.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCE1CQ5T751 118 aa2.39□□□□□ -2.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.3□□□□□ -2.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP5-8O75690 187 aa2.29□□□□□ -2.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.26□□□□□ -2.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.18□□□□□ -2.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.14□□□□□ -2.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.05□□□□□ -2.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.05□□□□□ -2.08
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.87□□□□□ -2.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHGR1C9JFL3 82 aa1.79□□□□□ -2.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.17□□□□□ -2.22
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