RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590124.5

EFTUD2-217, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-217ENST00000590124 MT1MQ8N339 61 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 V9GYY9 64 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 PSPHP1O15172 72 aa7.01□□□□□ -1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP12-3P60328 96 aa6.91□□□□□ -1.3
EFTUD2-217ENST00000590124 K7ERS5 55 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-217ENST00000590124 A6NED7 52 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-217ENST00000590124 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-217ENST00000590124 LCE4AQ5TA78 99 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-217ENST00000590124 LCE1DQ5T752 114 aa6.72□□□□□ -1.33
EFTUD2-217ENST00000590124 PCP4P48539 62 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-217ENST00000590124 MT4P47944 62 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-217ENST00000590124 ROMO1P60602 79 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
EFTUD2-217ENST00000590124 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-217ENST00000590124 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-217ENST00000590124 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.32□□□□□ -1.4
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.27□□□□□ -1.41
EFTUD2-217ENST00000590124 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP12-4P60329 112 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.2□□□□□ -1.42
EFTUD2-217ENST00000590124 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.11□□□□□ -1.43
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-217ENST00000590124 MT1AP04731 61 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6□□□□□ -1.45
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-217ENST00000590124 BRK1Q8WUW1 75 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 SVIPQ8NHG7 77 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-217ENST00000590124 PMAIP1Q13794 54 aa5.53□□□□□ -1.52
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP5-8O75690 187 aa5.51□□□□□ -1.53
EFTUD2-217ENST00000590124 MT3P25713 68 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-217ENST00000590124 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-217ENST00000590124 PRAC1Q96KF2 57 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-217ENST00000590124 PRO0628Q9UI54 55 aa5.18□□□□□ -1.58
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.17□□□□□ -1.58
EFTUD2-217ENST00000590124 MUC5ACP98088 5654 aa5.17□□□□□ -1.58
EFTUD2-217ENST00000590124 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
EFTUD2-217ENST00000590124 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-217ENST00000590124 LCE1EQ5T753 118 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-217ENST00000590124 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.95□□□□□ -1.62
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-217ENST00000590124 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.71□□□□□ -1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 LCE1CQ5T751 118 aa4.69□□□□□ -1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-217ENST00000590124 H3BS24 57 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 LUZP6Q538Z0 58 aa4.45□□□□□ -1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.24□□□□□ -1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 A0A0A0MQY5 61 aa4.23□□□□□ -1.73
EFTUD2-217ENST00000590124 LCE1FQ5T754 118 aa4.09□□□□□ -1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.97□□□□□ -1.77
EFTUD2-217ENST00000590124 PHGR1C9JFL3 82 aa3.66□□□□□ -1.82
EFTUD2-217ENST00000590124 NDUFAF8A1L188 74 aa3.62□□□□□ -1.83
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.59□□□□□ -1.83
EFTUD2-217ENST00000590124 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.34□□□□□ -1.87
EFTUD2-217ENST00000590124 PRM1P04553 51 aa3.32□□□□□ -1.88
EFTUD2-217ENST00000590124 INE1O15225 51 aa2.91□□□□□ -1.94
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.71□□□□□ -1.98
EFTUD2-217ENST00000590124 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.9 ms