RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 MT1EP04732 61 aa5.21□□□□□ -1.57
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.21□□□□□ -1.57
CTIF-205ENST00000587860 MT1LQ93083 61 aa5.2□□□□□ -1.58
CTIF-205ENST00000587860 LCE1FQ5T754 118 aa5.17□□□□□ -1.58
CTIF-205ENST00000587860 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.14□□□□□ -1.59
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.14□□□□□ -1.59
CTIF-205ENST00000587860 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.13□□□□□ -1.59
CTIF-205ENST00000587860 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CTIF-205ENST00000587860 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CTIF-205ENST00000587860 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.08□□□□□ -1.6
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.05□□□□□ -1.6
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.05□□□□□ -1.6
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.05□□□□□ -1.6
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.04□□□□□ -1.6
CTIF-205ENST00000587860 LCE1EQ5T753 118 aa5.04□□□□□ -1.6
CTIF-205ENST00000587860 MT1GP13640 62 aa5.03□□□□□ -1.6
CTIF-205ENST00000587860 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
CTIF-205ENST00000587860 MDN1Q9NU22 5596 aa4.95□□□□□ -1.62
CTIF-205ENST00000587860 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.95□□□□□ -1.62
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.93□□□□□ -1.62
CTIF-205ENST00000587860 MT1MQ8N339 61 aa4.9□□□□□ -1.63
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.88□□□□□ -1.63
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP12-4P60329 112 aa4.87□□□□□ -1.63
CTIF-205ENST00000587860 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.86□□□□□ -1.63
CTIF-205ENST00000587860 LCE1DQ5T752 114 aa4.81□□□□□ -1.64
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.78□□□□□ -1.64
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.77□□□□□ -1.65
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.71□□□□□ -1.66
CTIF-205ENST00000587860 LCE3BQ5TA77 95 aa4.65□□□□□ -1.67
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.64□□□□□ -1.67
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.63□□□□□ -1.67
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.54□□□□□ -1.68
CTIF-205ENST00000587860 LCE4AQ5TA78 99 aa4.51□□□□□ -1.69
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.5□□□□□ -1.69
CTIF-205ENST00000587860 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.5□□□□□ -1.69
CTIF-205ENST00000587860 SPRR2EP22531 72 aa4.48□□□□□ -1.69
CTIF-205ENST00000587860 SPRR2BP35325 72 aa4.48□□□□□ -1.69
CTIF-205ENST00000587860 SPRR2AP35326 72 aa4.48□□□□□ -1.69
CTIF-205ENST00000587860 PRM1P04553 51 aa4.42□□□□□ -1.7
CTIF-205ENST00000587860 MT3P25713 68 aa4.37□□□□□ -1.71
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP5-9P26371 169 aa4.35□□□□□ -1.71
CTIF-205ENST00000587860 MT1AP04731 61 aa4.28□□□□□ -1.72
CTIF-205ENST00000587860 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.26□□□□□ -1.73
CTIF-205ENST00000587860 SPRR2DP22532 72 aa4.26□□□□□ -1.73
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.08□□□□□ -1.76
CTIF-205ENST00000587860 MT4P47944 62 aa3.94□□□□□ -1.78
CTIF-205ENST00000587860 NEBP20929 6669 aa3.92□□□□□ -1.78
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.91□□□□□ -1.78
CTIF-205ENST00000587860 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.75□□□□□ -1.81
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.72□□□□□ -1.81
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.63□□□□□ -1.83
CTIF-205ENST00000587860 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.54□□□□□ -1.84
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.44□□□□□ -1.86
CTIF-205ENST00000587860 MUC5ACP98088 5654 aa3.43□□□□□ -1.86
CTIF-205ENST00000587860 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.4□□□□□ -1.86
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.39□□□□□ -1.87
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.35□□□□□ -1.87
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.33□□□□□ -1.88
CTIF-205ENST00000587860 LCE1CQ5T751 118 aa3.26□□□□□ -1.89
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.08□□□□□ -1.92
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.06□□□□□ -1.92
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.04□□□□□ -1.92
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.03□□□□□ -1.92
CTIF-205ENST00000587860 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.01□□□□□ -1.93
CTIF-205ENST00000587860 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.9□□□□□ -1.95
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP5-8O75690 187 aa2.89□□□□□ -1.95
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.84□□□□□ -1.96
CTIF-205ENST00000587860 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.71□□□□□ -1.97
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.7□□□□□ -1.98
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.61□□□□□ -1.99
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.51□□□□□ -2.01
CTIF-205ENST00000587860 PHGR1C9JFL3 82 aa2.22□□□□□ -2.05
CTIF-205ENST00000587860 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
CTIF-205ENST00000587860 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.46□□□□□ -2.18
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