RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MT1LQ93083 61 aa5.78□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.73□□□□□ -1.49
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.49
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.71□□□□□ -1.5
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.64□□□□□ -1.51
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 INE1O15225 51 aa5.58□□□□□ -1.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.53□□□□□ -1.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.51□□□□□ -1.53
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.51□□□□□ -1.53
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.51□□□□□ -1.53
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.5□□□□□ -1.53
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MT1GP13640 62 aa5.48□□□□□ -1.53
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MT1MQ8N339 61 aa5.45□□□□□ -1.54
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.43□□□□□ -1.54
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.41□□□□□ -1.54
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP5-9P26371 169 aa5.39□□□□□ -1.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.34□□□□□ -1.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.34□□□□□ -1.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.34□□□□□ -1.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MDN1Q9NU22 5596 aa5.27□□□□□ -1.57
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NEBP20929 6669 aa5.2□□□□□ -1.58
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPRR2EP22531 72 aa5.16□□□□□ -1.58
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPRR2BP35325 72 aa5.16□□□□□ -1.58
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPRR2AP35326 72 aa5.16□□□□□ -1.58
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.12□□□□□ -1.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPRR2DP22532 72 aa4.98□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.97□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MT1AP04731 61 aa4.9□□□□□ -1.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.88□□□□□ -1.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LCE3BQ5TA77 95 aa4.86□□□□□ -1.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.81□□□□□ -1.64
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP12-4P60329 112 aa4.76□□□□□ -1.65
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.69□□□□□ -1.66
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.62□□□□□ -1.67
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.58□□□□□ -1.68
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.51□□□□□ -1.69
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LCE4AQ5TA78 99 aa4.43□□□□□ -1.7
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.41□□□□□ -1.7
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MT3P25713 68 aa4.4□□□□□ -1.7
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.39□□□□□ -1.71
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LCE1DQ5T752 114 aa4.33□□□□□ -1.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MT4P47944 62 aa4.32□□□□□ -1.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.27□□□□□ -1.73
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.23□□□□□ -1.73
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRM1P04553 51 aa4.18□□□□□ -1.74
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.13□□□□□ -1.75
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.12□□□□□ -1.75
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.09□□□□□ -1.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.98□□□□□ -1.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.96□□□□□ -1.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.95□□□□□ -1.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.86□□□□□ -1.79
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.7□□□□□ -1.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LCE1EQ5T753 118 aa3.7□□□□□ -1.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.67□□□□□ -1.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MUC5ACP98088 5654 aa3.64□□□□□ -1.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP5-8O75690 187 aa3.56□□□□□ -1.84
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.49□□□□□ -1.85
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.47□□□□□ -1.85
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LCE1CQ5T751 118 aa3.47□□□□□ -1.85
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.46□□□□□ -1.86
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.44□□□□□ -1.86
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.35□□□□□ -1.87
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.19□□□□□ -1.9
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LCE1FQ5T754 118 aa3.07□□□□□ -1.92
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3□□□□□ -1.93
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.81□□□□□ -1.96
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.65□□□□□ -1.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PHGR1C9JFL3 82 aa2.58□□□□□ -2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.51□□□□□ -2.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.75□□□□□ -2.13
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