RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 V9GYY9 64 aa7.49□□□□□ -1.21
RNPS1-218ENST00000566180 Q1T7F1 81 aa7.44□□□□□ -1.22
RNPS1-218ENST00000566180 PSPHP1O15172 72 aa7.43□□□□□ -1.22
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.41□□□□□ -1.22
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP12-3P60328 96 aa7.4□□□□□ -1.22
RNPS1-218ENST00000566180 K7ERS5 55 aa7.38□□□□□ -1.23
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.37□□□□□ -1.23
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.37□□□□□ -1.23
RNPS1-218ENST00000566180 LCE4AQ5TA78 99 aa7.29□□□□□ -1.24
RNPS1-218ENST00000566180 LCE1DQ5T752 114 aa7.25□□□□□ -1.25
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.24□□□□□ -1.25
RNPS1-218ENST00000566180 A6NED7 52 aa7.18□□□□□ -1.26
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.18□□□□□ -1.26
RNPS1-218ENST00000566180 MT4P47944 62 aa7.17□□□□□ -1.26
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.11□□□□□ -1.27
RNPS1-218ENST00000566180 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RNPS1-218ENST00000566180 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.08□□□□□ -1.28
RNPS1-218ENST00000566180 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.06□□□□□ -1.28
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.03□□□□□ -1.28
RNPS1-218ENST00000566180 PCP4P48539 62 aa7.02□□□□□ -1.29
RNPS1-218ENST00000566180 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.01□□□□□ -1.29
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7□□□□□ -1.29
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RNPS1-218ENST00000566180 ROMO1P60602 79 aa6.91□□□□□ -1.3
RNPS1-218ENST00000566180 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.85□□□□□ -1.31
RNPS1-218ENST00000566180 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.83□□□□□ -1.32
RNPS1-218ENST00000566180 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.76□□□□□ -1.33
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.76□□□□□ -1.33
RNPS1-218ENST00000566180 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.75□□□□□ -1.33
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP12-4P60329 112 aa6.73□□□□□ -1.33
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.7□□□□□ -1.34
RNPS1-218ENST00000566180 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.57□□□□□ -1.36
RNPS1-218ENST00000566180 MT1AP04731 61 aa6.48□□□□□ -1.37
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.45□□□□□ -1.38
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.43□□□□□ -1.38
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.43□□□□□ -1.38
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.3□□□□□ -1.4
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.26□□□□□ -1.41
RNPS1-218ENST00000566180 BRK1Q8WUW1 75 aa6.21□□□□□ -1.42
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.15□□□□□ -1.42
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.13□□□□□ -1.43
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP5-8O75690 187 aa5.94□□□□□ -1.46
RNPS1-218ENST00000566180 MT3P25713 68 aa5.93□□□□□ -1.46
RNPS1-218ENST00000566180 PMAIP1Q13794 54 aa5.84□□□□□ -1.47
RNPS1-218ENST00000566180 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.83□□□□□ -1.48
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.64□□□□□ -1.51
RNPS1-218ENST00000566180 PRAC1Q96KF2 57 aa5.63□□□□□ -1.51
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.61□□□□□ -1.51
RNPS1-218ENST00000566180 MUC5ACP98088 5654 aa5.56□□□□□ -1.52
RNPS1-218ENST00000566180 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RNPS1-218ENST00000566180 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RNPS1-218ENST00000566180 LCE1EQ5T753 118 aa5.44□□□□□ -1.54
RNPS1-218ENST00000566180 PRO0628Q9UI54 55 aa5.42□□□□□ -1.54
RNPS1-218ENST00000566180 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.18□□□□□ -1.58
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.12□□□□□ -1.59
RNPS1-218ENST00000566180 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.09□□□□□ -1.59
RNPS1-218ENST00000566180 LCE1CQ5T751 118 aa5.04□□□□□ -1.6
RNPS1-218ENST00000566180 SVIPQ8NHG7 77 aa4.95□□□□□ -1.62
RNPS1-218ENST00000566180 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.94□□□□□ -1.62
RNPS1-218ENST00000566180 LUZP6Q538Z0 58 aa4.75□□□□□ -1.65
RNPS1-218ENST00000566180 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.66□□□□□ -1.66
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.59□□□□□ -1.67
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.55□□□□□ -1.68
RNPS1-218ENST00000566180 LCE1FQ5T754 118 aa4.42□□□□□ -1.7
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.24□□□□□ -1.73
RNPS1-218ENST00000566180 PHGR1C9JFL3 82 aa3.93□□□□□ -1.78
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.85□□□□□ -1.79
RNPS1-218ENST00000566180 NDUFAF8A1L188 74 aa3.8□□□□□ -1.8
RNPS1-218ENST00000566180 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.58□□□□□ -1.84
RNPS1-218ENST00000566180 PRM1P04553 51 aa3.53□□□□□ -1.84
RNPS1-218ENST00000566180 INE1O15225 51 aa3.05□□□□□ -1.92
RNPS1-218ENST00000566180 A0A0A0MQY5 61 aa2.96□□□□□ -1.94
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.96□□□□□ -1.94
RNPS1-218ENST00000566180 H3BS24 57 aa2.73□□□□□ -1.97
RNPS1-218ENST00000566180 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.52□□□□□ -2.01
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